کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
1180587 | 962860 | 2008 | 8 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Right-handed 14-Helix in β3-Peptides from L-Aspartic Acid Monomers
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
TFEtwo-dimensional NOE spectroscopyNOENOESYPBCRMSDSPC2,2,2-trifluoroethanol - 2،2،2-trifluoroethanolβ-Peptides - β-پپتیدهایnuclear overhauser effect - اثر بیش از حد هسته ایNMR - تشدید مغناطیسی هستهای Molecular dynamics - دینامیک ملکولی یا پویایی مولکولیcircular dichroism - رنگ تابی دورانیSolution structure - ساختار راه حلSimple Point Charge - شارژ سادهMD simulations - شبیه سازی MDPeriodic Boundary Conditions - شرایط مرزی دوره ایNuclear magnetic resonance spectroscopy - طیف سنجی رزونانس مغناطیسی هسته ایroot mean square deviation - میانگین انحراف مربع ریشهNanosecond - نانوسکوردPicosecond - پیکوساکونه
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
شیمی
شیمی آنالیزی یا شیمی تجزیه
پیش نمایش صفحه اول مقاله

چکیده انگلیسی
β-Peptides made from L-aspartic acid monomers form a new class of β3-peptides. Here we report the first three-dimensional NMR solution structure of a β3-hexapeptide (1) from L-aspartic acid monomers in 2,2,2-trifluoroethanol (TFE). We show that 1 forms a right-handed 14-helical structure in TFE. α-peptides from naturally occurring L-amino acids adopt a right-handed α-helix whereas β3-peptides formed from β3-amino acids derived from naturally occurring L-amino acids form left-handed 14-helices. The right-handed 14-helical conformation of 1 is a better mimic of α-peptide conformations. Using the NMR structure of 1 in TFE, we further study the conformation of 1 in water, as well as two similar β3-peptides (2 and 3) in water and TFE by molecular dynamics (MD) simulations. NMR and MD results suggest loss of secondary structure of 1 in water and show that it forms a fully extended structure. 2 and 3 contain residues with oppositely charged side chains that engage in salt-bridge interactions and dramatically stabilize the 14-helical conformation in aqueous media.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics - Volume 1784, Issue 4, April 2008, Pages 658-665
Journal: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics - Volume 1784, Issue 4, April 2008, Pages 658-665
نویسندگان
Kamaljit Kaur, Tara Sprules, Wael Soliman, Reem Beleid, Sahar Ahmed,