کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
15439 | 1413 | 2007 | 7 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Inferring gene regulatory networks from temporal expression profiles under time-delay and noise
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
مهندسی شیمی
بیو مهندسی (مهندسی زیستی)
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
Ordinary differential equations (ODE) have been widely used for modeling and analysis of dynamic gene networks in systems biology. In this paper, we propose an optimization method that can infer a gene regulatory network from time-series gene expression data. Specifically, the following four cases are considered: (1) reconstruction of a gene network from synthetic gene expression data with noise, (2) reconstruction of a gene network from synthetic gene expression data with time-delay, (3) reconstruction of a gene network from synthetic gene expression data with noise and time-delay, and (4) reconstruction of a gene network from experimental time-series data in budding yeast cell cycle.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Computational Biology and Chemistry - Volume 31, Issue 4, August 2007, Pages 239–245
Journal: Computational Biology and Chemistry - Volume 31, Issue 4, August 2007, Pages 239–245
نویسندگان
Shinuk Kim, Junil Kim, Kwang-Hyun Cho,