کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
1936261 | 1050687 | 2007 | 7 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Major human γ-aminobutyrate transporter: In silico prediction of substrate efficacy
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شیمی
پیش نمایش صفحه اول مقاله

چکیده انگلیسی
The inhibitory γ-aminobutyric acid transporter subtype 1 (GAT1) maintains low resting synaptic GABA level, and is a potential target for antiepileptic drugs. Here we report a high scored binding mode that associates GABA with gating in a homology model of the human GAT1. Docking and molecular dynamics calculations recognize the amino function of GABA in the H-bonding state favoring TM1 and TM8 helix residues Y60 and S396, respectively. This ligand binding mode visibly ensures the passage of GABA and substrate inhibitors (R)-homo-β-Pro, (R)-nipecotic acid, and guvacine. It might therefore represent the principle, sufficient for sorting out less-effective or non-GAT ligands such as β-Pro, (S)-nipecotic acid, (R)-baclofen, Glu, and Leu.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Biochemical and Biophysical Research Communications - Volume 364, Issue 4, 28 December 2007, Pages 952–958
Journal: Biochemical and Biophysical Research Communications - Volume 364, Issue 4, 28 December 2007, Pages 952–958
نویسندگان
Anna Palló, Ákos Bencsura, László Héja, Tamás Beke, András Perczel, Julianna Kardos, Ágnes Simon,