کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
2830157 | 1163360 | 2007 | 7 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Single nucleotide polymorphisms identification in expressed genes of Schistosoma mansoni
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
TPISm23NQScSNPSm14nsSNPTriosephosphate isomeraseRT-PCRPDBORFcDNA - cDNAComplementary DNA - DNA تکمیلیDNA - DNA یا اسید دزوکسی ریبونوکلئیکdeoxyribonucleic acid - اسید deoxyribonucleicRNA - اسید ریبونوکلئیکribonucleic acid - اسید ریبونوکلئیکbase pair - جفت پایهComputational biology - زیستشناسی محاسباتیSchistosoma mansoni - شیستوزومای مانسونیopen reading frame - قاب خواندن بازComparative modeling - مدل سازی مقایسه ایReverse transcriptase-polymerase chain reaction - واکنش زنجیره ای واکنش زنجیره ای واکنش زنجیره ایpolymerase chain reaction - واکنش زنجیره ای پلیمرازPCR - واکنش زنجیرهٔ پلیمرازProtein Data Bank - پروتئین بانک اطلاعاتیSingle nucleotide polymorphism - پلیمورفیسم تک نوکلئوتیدیSNP - چندریختی تک-نوکلئوتیدCathepsin B - کاتئفسین B
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شناسی مولکولی
پیش نمایش صفحه اول مقاله

چکیده انگلیسی
Single nucleotide polymorphism (SNP) markers have been shown to be useful in genetic investigations of medically important parasites and their hosts. In this paper, we describe the prediction and validation of SNPs in ESTs of Schistosoma mansoni. We used 107,417 public sequences of S. mansoni and identified 15,614 high-quality candidate SNPs in 12,184 contigs. The presence of predicted SNPs was observed in well characterized antigens and vaccine candidates such as those coding for myosin; Sm14 and Sm23; cathepsin B and triosephosphate isomerase (TPI). Additionally, SNPs were experimentally validated for the cathepsin B. A comparative model of the S. mansoni cathepsin B was built for predicting the possible consequences of amino acid substitutions on the protein structure. An analysis of the substitutions indicated that the amino acids were mostly located on the surface of the molecule, and we found no evidence for a significant conformational change of the enzyme. However, at least one of the substitutions could result in a structural modification of an epitope.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Molecular and Biochemical Parasitology - Volume 154, Issue 2, August 2007, Pages 134-140
Journal: Molecular and Biochemical Parasitology - Volume 154, Issue 2, August 2007, Pages 134-140
نویسندگان
Mariana Simões, Diana Bahia, Adhemar Zerlotini, Kleider Torres, François Artiguenave, Goran Neshich, Paula Kuser, Guilherme Oliveira,