Molecular phylogenetic diversity of the emerging mucoralean fungus Apophysomyces: Proposal of three new species

BackgroundApophysomyces is a monotypic genus belonging to the order Mucorales. The species Apophysomyces elegans has been reported to cause severe infections in immunocompromised and immunocompetent people. In a previous study of Álvarez et al. 3 [J Clin Microbiol 2009;47:1650–6], we demonstrated a high variability among the 5.8S rRNA gene sequences of clinical strains of A. elegans.Material and methodsWe performed a polyphasic study based on the analysis of the sequences of the histone 3 gene, the internal transcribed spacer region of the rDNA gene, and domains D1 and D2 of the 28S rRNA gene, as well as by evaluation of some relevant morphological and physiological characteristics of a set of clinical and environmental strains of A. elegans.Results and conclusionsWe have demonstrated that A. elegans is a complex of species. We propose as new species Apophysomyces ossiformis, characterised by bone-shaped sporangiospores, Apophysomyces trapeziformis, with trapezoid-shaped sporangiospores, and Apophysomyces variabilis, with variable-shaped sporangiospores. These species failed to assimilate esculin, whereas A. elegans was able to assimilate that glycoside. Amphotericin B and posaconazole are the most active in vitro drugs against Apophysomyces.

ResumenAntecedentesApophysomyces es un género monoespécifico perteneciente al orden Mucorales. La especie Apophysomyces elegans, ha sido reportada como causante de infecciones severas en pacientes inmunocomprometidos e inmunocompetentes. En un estudio previo (Álvarez et al., J Clin Microbiol. 2009;47:1650–6 ), demostramos la elevada variabilidad dentro de las secuencias del gen 5.8S del ARNr en un grupo de cepas clínicas de A. elegans.Material y métodosHemos realizado un estudio polifásico basado en el análisis de las secuencias del gen de la histona 3, la región de los espaciadores internos del ADNr y los dominios D1 y D2 del gen 28S del ARNr, así como la evaluación de caracteres morfológicos y fisiológicos relevantes de un grupo de cepas clínicas y ambientales de A. elegans.Resultados y conclusionesHemos demostrado que A. elegans es un complejo de especies. Proponemos como nuevas especies para la ciencia Apophysomyces ossiformis, caracterizada por sus esporangiosporas con forma de hueso; Apophysomyces trapeziformis, con esporangiosporas trapezoidales; y Apophysomyces variabilis, con esporangiosporas de formas variables. Las nuevas especies no asimilan la esculina, en tanto que A. elegans fue capaz de asimilar dicho glicósido. La anfotericina B y el posaconazol fueron los antifúngicos más activos frente a Apophysomyces.