کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
4499942 1319938 2015 11 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Modeling HIV-1 viral capsid nucleation by dynamical systems
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری علوم کشاورزی و بیولوژیک علوم کشاورزی و بیولوژیک (عمومی)
پیش نمایش صفحه اول مقاله
Modeling HIV-1 viral capsid nucleation by dynamical systems
چکیده انگلیسی

There are two stages generally recognized in the viral capsid assembly: nucleation and elongation. This paper focuses on the nucleation stage and develops mathematical models for HIV-1 viral capsid nucleation based on six-species dynamical systems. The Particle Swarm Optimization (PSO) algorithm is used for parameter fitting to estimate the association and dissociation rates from biological experiment data. Numerical simulations of capsid protein (CA) multimer concentrations demonstrate a good agreement with experimental data. Sensitivity and elasticity analysis of CA multimer concentrations with respect to the association and dissociation rates further reveals the importance of CA trimer-of- dimers in the nucleation stage of viral capsid self- assembly.

ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Mathematical Biosciences - Volume 270, Part A, December 2015, Pages 95–105
نویسندگان
, , , , ,