کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
4500782 | 1320022 | 2009 | 8 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
A Poisson model of sequence comparison and its application to coronavirus phylogeny
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
علوم کشاورزی و بیولوژیک
علوم کشاورزی و بیولوژیک (عمومی)
پیش نمایش صفحه اول مقاله

چکیده انگلیسی
In this paper, we propose two metrics to compare DNA and protein sequences based on a Poisson model of word occurrences. Instead of comparing the frequencies of all fixed-length words in two sequences, we consider (1) the probability of ‘generating’ one sequence under the Poisson model estimated from the other; (2) their different expression levels of words. Phylogenetic trees of 25 viruses including SARS-CoVs are constructed to illustrate our approach.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Mathematical Biosciences - Volume 217, Issue 2, February 2009, Pages 159–166
Journal: Mathematical Biosciences - Volume 217, Issue 2, February 2009, Pages 159–166
نویسندگان
Xiaoqi Zheng, Yufang Qin, Jun Wang,