کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
4502468 | 1320569 | 2012 | 7 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Ascertainment correction for a population tree via a pruning algorithm for likelihood computation
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
علوم کشاورزی و بیولوژیک
علوم کشاورزی و بیولوژیک (عمومی)
پیش نمایش صفحه اول مقاله
![عکس صفحه اول مقاله: Ascertainment correction for a population tree via a pruning algorithm for likelihood computation Ascertainment correction for a population tree via a pruning algorithm for likelihood computation](/preview/png/4502468.png)
چکیده انگلیسی
We present a method for correcting ascertainment-bias in a coalescent-based likelihood for population trees. Our method is computationally simple and fast. To correct for the bias we compute the probability of allele-counts conditioned on the locus being included. This conditional probability is simply the uncorrected likelihood divided by the inclusion probability. A modification of a pruning algorithm is introduced so that the inclusion probability can be computed with a single run of the algorithm. Our computation is exact and avoids Monte-Carlo based methods.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Theoretical Population Biology - Volume 82, Issue 1, August 2012, Pages 59–65
Journal: Theoretical Population Biology - Volume 82, Issue 1, August 2012, Pages 59–65
نویسندگان
Arindam RoyChoudhury, Elizabeth A. Thompson,