کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
4502897 1320608 2009 7 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Efficient maximum likelihood pedigree reconstruction
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری علوم کشاورزی و بیولوژیک علوم کشاورزی و بیولوژیک (عمومی)
پیش نمایش صفحه اول مقاله
Efficient maximum likelihood pedigree reconstruction
چکیده انگلیسی

A simple and efficient algorithm is presented for finding a maximum likelihood pedigree using microsatellite (STR) genotype information on a complete sample of related individuals. The computational complexity of the algorithm is at worst (O(n32n))(O(n32n)), where nn is the number of individuals. Thus it is possible to exhaustively search the space of all pedigrees of up to thirty individuals for one that maximizes the likelihood. A priori age and sex information can be used if available, but is not essential. The algorithm is applied in a simulation study, and to some real data on humans.

ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Theoretical Population Biology - Volume 76, Issue 4, December 2009, Pages 285–291
نویسندگان
,