کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5419277 | 1506997 | 2006 | 8 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
An evaluation of non-periodic boundary condition models in molecular dynamics simulations using prion octapeptides as probes
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
شیمی
شیمی تئوریک و عملی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
Molecular dynamics simulations have been performed under periodic boundary conditions and using four non-periodic solvation models. The biomolecular probe in these simulations was a single repeat of the copper-binding octapeptide in the human prion protein, PHGGGWGQ. Although the alternative non-periodic solvation models enable a reduction in computational time, the dynamical disadvantages are considerable when using any of these four non-periodic models. For simulations of systems similar to the test system, periodic boundary conditions are a better alternative than any of the four local models.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Molecular Structure: THEOCHEM - Volume 760, Issues 1â3, 28 February 2006, Pages 91-98
Journal: Journal of Molecular Structure: THEOCHEM - Volume 760, Issues 1â3, 28 February 2006, Pages 91-98
نویسندگان
Eva-Stina Riihimäki, José Manuel MartÃnez, Lars Kloo,