Genomic investigations of evolutionary dynamics and epistasis in microbial evolution experiments

آزمایش های تکامل میکروبی ما را قادر می سازد تا در زمان واقعی سازگاری را ببینیم و برای تکرارپذیری و قابل پیش بینی بودن تکامل، با مقایسه جمعیت های تکثیر مشابه، کمیت بگذاریم. علاوه بر این، ما می توانیم انواع اجدادی را برای بررسی تغییرات در زمان تکاملی احیا کنیم. تا همین اواخر، تجربیات تجربی محدود به اندازه گیری تغییرات فنوتیپی و یا ردیابی چند نشانگر ژنتیکی در طول زمان بوده است. با این حال، پیشرفت های اخیر در تکنولوژی توالی در حال حاضر امکان کلون های گسترده یا نمونه های کل جمعیت از آزمایشات تکامل میکروبی را فراهم می کند. در اینجا، کار اخیر را با بهره گیری از این تکنیک ها برای درک مبنای ژنومی تغییرات تکاملی در سیستم های تجربی بررسی می کنیم. ما ابتدا به مطالعاتی که تجزیه و تحلیل پویایی تکامل ژنوم در سیستم های میکروبی را متمرکز می کنیم، تمرکز می کنیم. سپس کار بررسی را انجام می دهیم که از مشاهدات تکامل دنباله استفاده می کند تا جنبه هایی از منظره تناسب اندام پایه را بیابد، تمرکز بر تعاملات اپیستاتیک بین جهش ها و محدودیت هایی که این تعامل ها بر سازگاری قرار می دهند.