کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5905799 | 1569846 | 2014 | 9 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
The complete chloroplast genome sequence of Taxus chinensis var. mairei (Taxaceae): loss of an inverted repeat region and comparative analysis with related species
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
Taxus chinensis var. maireiIGScpDNAPalindromicSOAPdeoxyribonucleaseSSRsSSCtRNARNaseORFlarge single-copy regionInDelLSCSSRCRACSt - CSTchloroplast DNA - DNA کلرپلاستDNAse - DNAaseAdenosine Triphosphate - آدنوزین تری فسفاتATP - آدنوزین تری فسفات یا ATPamino acid - آمینو اسیدBLAST, basic local alignment search tool - ابزار پایهای برای جستجوی برهم نهیهای موضعی، بلاستtransfer ribonucleic acid - انتقال ریبونوکلئیک اسیدBlast - انفجارcoding sequence - توالی کدگذاریinverted repeat - تکرار معکوسinsertion/deletion - درج / حذفsimple sequence repeat - دنباله ساده تکرار کنیدDogma - دگمهforward - رو به جلوribonuclease - ریبونوکلئازChloroplast - سبزدیسه، کلروپلاستBLAT - شمارنده بالاintergenic spacer - فضاپیمای بینابینیopen reading frame - قاب خواندن بازInverted - معکوسNADH - نادانnucleotide(s) - نوکلئوتید (ها)NAD, nicotinamide adenine dinucleotide - نیکوتینامید آدنین دینوکلئوتیدpolymerase chain reaction - واکنش زنجیره ای پلیمرازPCR - واکنش زنجیرهٔ پلیمرازChloroplast genome - ژنوم کلروپلاستCdS - کادمیم سولفید، سولفید کادمیمkilobase - کیلوبایزsmall single-copy region - یک منطقه کوچکی تک کپی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
Taxus chinensis var. mairei (Taxaceae) is a domestic variety of yew species in local China. This plant is one of the sources for paclitaxel, which is a promising antineoplastic chemotherapy drugs during the last decade. We have sequenced the complete nucleotide sequence of the chloroplast (cp) genome of T. chinensis var. mairei. The T. chinensis var. mairei cp genome is 129,513Â bp in length, with 113 single copy genes and two duplicated genes (trnI-CAU, trnQ-UUG). Among the 113 single copy genes, 9 are intron-containing. Compared to other land plant cp genomes, the T. chinensis var. mairei cp genome has lost one of the large inverted repeats (IRs) found in angiosperms, fern, liverwort, and gymnosperm such as Cycas revoluta and Ginkgo biloba L. Compared to related species, the gene order of T. chinensis var. mairei has a large inversion of ~Â 110Â kb including 91 genes (from rps18 to accD) with gene contents unarranged. Repeat analysis identified 48 direct and 2 inverted repeats 30Â bp long or longer with a sequence identity greater than 90%. Repeated short segments were found in genes rps18, rps19 and clpP. Analysis also revealed 22 simple sequence repeat (SSR) loci and almost all are composed of A or T.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Gene - Volume 540, Issue 2, 1 May 2014, Pages 201-209
Journal: Gene - Volume 540, Issue 2, 1 May 2014, Pages 201-209
نویسندگان
Yanzhen Zhang, Ji Ma, Bingxian Yang, Ruyi Li, Wei Zhu, Lianli Sun, Jingkui Tian, Lin Zhang,