کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5907710 | 1160860 | 2016 | 7 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Profiling of Brevibacillus borstelensis transcriptome exposed to high temperature shock
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
EIPGIPHspRT-PCRmRNADGEcDNA - cDNAComplementary DNA - DNA تکمیلی°C - ° CBLAST, basic local alignment search tool - ابزار پایهای برای جستجوی برهم نهیهای موضعی، بلاستBlast - انفجارDifferential gene expression - بیان ژن دیفرانسیلKEGG یا Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes - دایرة المعارف ژن ها و ژنوم کیوتو Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes - دایره المعارف ژنتیک ژن ها و ژنوم کیوتوdegree centigrade - درجه سانتیگرادmessenger ribonucleic acid - رسوب ریبونوکلئیک اسیدHeat shock - شوک حرارتیNon-redundant - غیر انحصاریGene ontology - هستیشناسی ژنیHeat shock protein - پروتئین شوک حرارتGene expression profile - پروفایل بیان ژن
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
To understand the molecular mechanisms underlying the ability of the bacteria to survive at high temperature, gene expression profile of Brevibacillus borstelensis at 55 °C during 5 and 10 min heat shock period was carried out by high-throughput sequencing technology. A total of 2555 non-redundant transcripts were annotated. A total of 575 genes at 5 min and 400 genes at 10 min exhibited significant differential expression in response to temperature upshift from 50 to 55 °C. Genes up-regulated under heat shock were associated with metabolism (mtnE), membrane transport, signal transduction, transcriptional regulation (ycxD, codY) and folding and sorting (hsp90). A larger number of genes encoding hypothetical proteins were identified. RT-PCR experimental results carried out on genes expressed under heat shock were found to be consistent with transcriptome data. The results enhance our understanding of adaptation strategy of thermophilic bacteria thereby providing a strong background for in depth research in thermophiles.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Genomics - Volume 107, Issue 1, January 2016, Pages 33-39
Journal: Genomics - Volume 107, Issue 1, January 2016, Pages 33-39
نویسندگان
S. Tripathy, S.K. Padhi, R. Sen, S. Mohanty, M. Samanta, N.K. Maiti,