کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5908060 | 1160974 | 2007 | 6 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Estimating genotyping error rates from Mendelian errors in SNP array genotypes and their impact on inference
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
پیش نمایش صفحه اول مقاله
![عکس صفحه اول مقاله: Estimating genotyping error rates from Mendelian errors in SNP array genotypes and their impact on inference Estimating genotyping error rates from Mendelian errors in SNP array genotypes and their impact on inference](/preview/png/5908060.png)
چکیده انگلیسی
A simple method of inferring the genotyping error rate of SNP arrays and similar high-throughput genotyping methods from Mendelian errors is described. Application to genotypes from small families using the Affymetrix GeneChip Human Mapping 50Â k Array indicates an error rate of about 0.1%, and this rate can be reduced by increasing the quality criterion for calls, though at the cost of a reduced genotype call rate, which limits the benefit available. Simulated data are used to show that the number of SNPs on this array is sufficient for such a low error rate to have little impact on identical by descent-based inference for disease linkage in sib-pair studies.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Genomics - Volume 90, Issue 3, September 2007, Pages 291-296
Journal: Genomics - Volume 90, Issue 3, September 2007, Pages 291-296
نویسندگان
Ian W. Saunders, Jesper Brohede, Garry N. Hannan,