Gene Networks in Plant Biology: Approaches in Reconstruction and Analysis

با وجود اینکه مقادیر فراوانی داده های بیان ژن در سطح ژنوم در گیاهان موجود است، این چالش به طور موثر برای یافتن این اطلاعات برای کشف ژن ها و شبکه های ژنی همچون افرادی است که ویژگی های مهم زراعی را کنترل می کنند. این شبکه ها منعکس کننده تعاملات بالقوه بین ژن ها است و بنابراین می تواند منجر به درک سیستماتیک از مکانیزم های مولکولی فرآیندهای بیولوژیکی هدفمند شود. ما در مورد روش های تحلیل شبکه های ژنی با استفاده از داده های بیان ژن بحث می کنیم، به ویژه با تمرکز بر چهار رویکرد آماری رایج مورد استفاده برای بازسازی شبکه ها: همبستگی، انتخاب ویژگی در یادگیری نظارت، مدل گرافیکی احتمالاتی و پیش بینی متا. علاوه بر این، ما در مورد استفاده موثر از این روش ها برای به دست آوردن درک عمیق از سیستم های بیولوژیکی در گیاهان بحث می کنیم.