کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
6142105 1594339 2016 20 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Systems biology: A tool for charting the antiviral landscape
ترجمه فارسی عنوان
زیست شناسی سیستم: ابزار برای چیدمان چشم انداز ضد ویروسی
ترجمه چکیده
برنامه های ضد ویروس میزبان که پس از عفونت ویروسی آغاز می شوند، یک وب پویا و پیچیده از پاسخ ها هستند که ما به طور کلی به عنوان یک چشم انداز ضد ویروس نامیده می شود. رویکردهای متعارف برای مطالعه پاسخهای ضد ویروسی عمدتا از سیستمهای کمکی استفاده می کنند تا عملکرد یک یا چند مجموعه مولکول را ارزیابی کنند. زیست شناسی سیستم یک رویکرد جامع است که کل سیستم را به عنوان یک کل در نظر می گیرد، نه مولفه ها یا مولکول های فردی. روشی مبتنی بر بیولوژی مبتنی بر سیستم، تجزیه و تحلیل بی طرفانه و جامع از چشم انداز ضد ویروسی را تسهیل می کند، در حالی که اجازه می دهد تا کشف خواص ظهور که از طریق روش های مرسوم از دست رفته است. چشم انداز ضد ویروسی را می توان به عنوان یک سلسله مراتب پیچیدگی مشاهده کرد، شروع به کل سطح ارگانیزم و پیشرفت به سمت پایین به بافت های جدا شده، جمعیت سلول ها و سلول های تک. در این بررسی، ما در مورد چگونگی کاربرد زیست شناسی سیستم برای درک بهتر چشم انداز ضد ویروسی در هر یک از این لایه ها بحث خواهیم کرد. در سطح ارگانیسم، کراس همکار یک منبع ژنتیکی ارزشمند برای ارزیابی اینکه چگونه تنوع ژنتیکی بر پاسخ ویروس ویروسی تأثیر می گذارد، است. ترانسپکتومایک سلول های باقیمانده باقیمانده و جدا شده به عنوان یک ابزار مهم برای تجزیه و تحلیل جامع از پاسخ های ضد ویروسی در هر دو سطح بافت و سلول پیچیده است. در نهایت، تکنیک های جدید در تجزیه و تحلیل تک سلولی، ابزارهای در حال ظهور است که به درک ما در مورد اینکه چگونه سلول های فردی در یک سلول آلوده به کل جمعیت به چشم انداز کلی ضد ویروسی کمک می کنند، انقلابی خواهد شد.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری ایمنی شناسی و میکروب شناسی ویروس شناسی
چکیده انگلیسی
The host antiviral programs that are initiated following viral infection form a dynamic and complex web of responses that we have collectively termed as “the antiviral landscape”. Conventional approaches to studying antiviral responses have primarily used reductionist systems to assess the function of a single or a limited subset of molecules. Systems biology is a holistic approach that considers the entire system as a whole, rather than individual components or molecules. Systems biology based approaches facilitate an unbiased and comprehensive analysis of the antiviral landscape, while allowing for the discovery of emergent properties that are missed by conventional approaches. The antiviral landscape can be viewed as a hierarchy of complexity, beginning at the whole organism level and progressing downward to isolated tissues, populations of cells, and single cells. In this review, we will discuss how systems biology has been applied to better understand the antiviral landscape at each of these layers. At the organismal level, the Collaborative Cross is an invaluable genetic resource for assessing how genetic diversity influences the antiviral response. Whole tissue and isolated bulk cell transcriptomics serves as a critical tool for the comprehensive analysis of antiviral responses at both the tissue and cellular levels of complexity. Finally, new techniques in single cell analysis are emerging tools that will revolutionize our understanding of how individual cells within a bulk infected cell population contribute to the overall antiviral landscape.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Virus Research - Volume 218, 15 June 2016, Pages 2-9
نویسندگان
, , ,