کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
6372281 | 1624140 | 2016 | 11 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
An approximate stationary solution for multi-allele neutral diffusion with low mutation rates
ترجمه فارسی عنوان
یک راه حل تقریبی ثابت برای انتشار چندطبقه خنثی با نرخ جهش کم
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
چند آلل رایت فیشر، تکامل عاطفی، به جلو معادله کلموگروف،
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
علوم کشاورزی و بیولوژیک
علوم کشاورزی و بیولوژیک (عمومی)
چکیده انگلیسی
We address the problem of determining the stationary distribution of the multi-allelic, neutral-evolution Wright-Fisher model in the diffusion limit. A full solution to this problem for an arbitrary KÃK mutation rate matrix involves solving for the stationary solution of a forward Kolmogorov equation over a (Kâ1)-dimensional simplex, and remains intractable. In most practical situations mutations rates are slow on the scale of the diffusion limit and the solution is heavily concentrated on the corners and edges of the simplex. In this paper we present a practical approximate solution for slow mutation rates in the form of a set of line densities along the edges of the simplex. The method of solution relies on parameterising the general non-reversible rate matrix as the sum of a reversible part and a set of (Kâ1)(Kâ2)/2 independent terms corresponding to fluxes of probability along closed paths around faces of the simplex. The solution is potentially a first step in estimating non-reversible evolutionary rate matrices from observed allele frequency spectra.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Theoretical Population Biology - Volume 112, December 2016, Pages 22-32
Journal: Theoretical Population Biology - Volume 112, December 2016, Pages 22-32
نویسندگان
Conrad J. Burden, Yurong Tang,