کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
6372325 1624151 2015 15 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Estimation of the variance effective population size in age structured populations
ترجمه فارسی عنوان
برآورد واریانس اندازه جمعیت مؤثر در جمعیت های ساختار یافته است
کلمات کلیدی
اندازه جمعیت مؤثر، روش زمانی، تعداد موثر آلل مستقل، نسلهای همپوشانی، فاصله اطمینان،
ترجمه چکیده
اندازه جمعیت مؤثر برای جمعیت با ساختار سنی معمولا تخمین زده می شود و روش زمانی اغلب برآوردهای غلط است. در اینجا، ما یک عبارت صریح برای یک عامل اصلاح ارائه می دهیم که همراه با تخمین ها از روش زمانی، تخمین ها را تقریبا بی طرفانه می کند. محاسبه فاکتور اصلاح نیاز به دانش از توزیع توام فرزندان سن و احتمال احتمالات بقا و هم چنین همبستگی احتمالی بین بقا و موفقیت تولید مثل دارد. به منظور تسریع این الزامات، ما نشان می دهیم که تنها لحظات اول این توزیع ها باید شناخته شوند، اگر زمان بین نمونه ها بزرگ باشد، یا افراد در تمام رده های سنی که باز تولید می شوند، نمونه گیری می شوند. یک عبارت تقریبا صریح تقریبی برای ضریب همبستگی انحراف معیار برآوردگر مشتق شده است و می توان از آن برای ساخت فواصل اطمینان و روش های بهینه سازی وزن اطلاعات از نشانگرهای مختلف استفاده کرد. ضریب همبستگی انحراف استاندارد نیز می تواند برای طراحی مطالعات مورد استفاده قرار گیرد و ما نشان می دهیم که برای به حداکثر رساندن دقت برای یک اندازه نمونه مورد نظر، افراد از کلاس های سالخوردگی باید نمونه برداری شوند، زیرا واریانس انتظار می رود که تغییر فرکانس آلل بیشتر و آسان تر باشد تخمین زدن. با این حال، برای جمعیت هایی با اندازه های متغیر سن متغیر، دقت روش کاهش می یابد زمانی که نمونه ها از کلاس های قدیمی تر با تغییرات جمعیتی بالا گرفته می شود. ما همچنین یک روش برای برآورد همزمان واریانس مؤثر و جمعیت جمعیتی را ارائه می دهیم.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری علوم کشاورزی و بیولوژیک علوم کشاورزی و بیولوژیک (عمومی)
چکیده انگلیسی
The variance effective population size for age structured populations is generally hard to estimate and the temporal method often gives biased estimates. Here, we give an explicit expression for a correction factor which, combined with estimates from the temporal method, yield approximately unbiased estimates. The calculation of the correction factor requires knowledge of the age specific offspring distribution and survival probabilities as well as possible correlation between survival and reproductive success. In order to relax these requirements, we show that only first order moments of these distributions need to be known if the time between samples is large, or individuals from all age classes which reproduce are sampled. A very explicit approximate expression for the asymptotic coefficient of standard deviation of the estimator is derived, and it can be used to construct confidence intervals and optimal ways of weighting information from different markers. The asymptotic coefficient of standard deviation can also be used to design studies and we show that in order to maximize the precision for a given sample size, individuals from older age classes should be sampled since their expected variance of allele frequency change is higher and easier to estimate. However, for populations with fluctuating age class sizes, the accuracy of the method is reduced when samples are taken from older age classes with high demographic variation. We also present a method for simultaneous estimation of the variance effective and census population size.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Theoretical Population Biology - Volume 101, May 2015, Pages 9-23
نویسندگان
, ,