کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
6486824 | 1416272 | 2018 | 14 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Hardware acceleration of BWA-MEM genomic short read mapping for longer read lengths
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
مهندسی شیمی
بیو مهندسی (مهندسی زیستی)
پیش نمایش صفحه اول مقاله
![عکس صفحه اول مقاله: Hardware acceleration of BWA-MEM genomic short read mapping for longer read lengths Hardware acceleration of BWA-MEM genomic short read mapping for longer read lengths](/preview/png/6486824.png)
چکیده انگلیسی
To improve performance, we perform a classification of the inefficiency of the underlying systolic array architecture. By eliminating idle regions as much as possible, efficiency is improved by up to +95%. Moreover, adaptive load balancing intelligently distributes work between host and accelerator to ensure use of an accelerator always results in performance improvement, which in GPU-constrained scenarios provides up to +45% more performance.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Computational Biology and Chemistry - Volume 75, August 2018, Pages 54-64
Journal: Computational Biology and Chemistry - Volume 75, August 2018, Pages 54-64
نویسندگان
Ernst Joachim Houtgast, Vlad-Mihai Sima, Koen Bertels, Zaid Al-Ars,