کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
7608818 1493389 2018 8 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Peptide retention prediction using hydrophilic interaction liquid chromatography coupled to mass spectrometry
ترجمه فارسی عنوان
پیش بینی احتباس پپتید با استفاده از کروماتوگرافی مایع متقاطع هیدرولیکی همراه با اسپکترومتری جرمی
کلمات کلیدی
پپتیده نگهداری، کروماتوگرافی تعامل مایع هیدروفلیکی، آمینو اسید، زمان نگهداری، مدل پیش بینی،
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه شیمی شیمی آنالیزی یا شیمی تجزیه
چکیده انگلیسی
A model that predicts retention for peptides using a HALO® penta-HILIC column and gradient elution was created. Coefficients for each amino acid were derived using linear regression analysis and these coefficients can be summed to predict the retention of peptides. This model has a high correlation between experimental and predicted retention times (0.946), which is on par with previous RP and HILIC models. External validation of the model was performed using a set of H. pylori samples on the same LC-MS system used to create the model, and the deviation from actual to predicted times was low. Apart from amino acid composition, length and location of amino acid residues on a peptide were examined and two site-specific corrections for hydrophobic residues at the N-terminus as well as hydrophobic residues one spot over from the N-terminus were created.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Chromatography A - Volume 1537, 16 February 2018, Pages 58-65
نویسندگان
, , ,