کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
7687706 1495862 2018 36 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
The divide and conquer strategies for deep phosphoproteomics analysis
ترجمه فارسی عنوان
استراتژی تقسیم و تسخیر برای تجزیه و تحلیل عمیق فسفوپروتومیک
کلمات کلیدی
فسفر پروتئومیکس، زیر فسفوپروتئومیکس، طیف سنجی جرمی، فسفوپروتئوم تیروزین، فسفوپتید درون زا تداخل،
ترجمه چکیده
با پیشرفت تکنیک های پروتئومیک مبتنی بر اسپکترومتری جرمی، هزاران سایت فسفوریلاسیون را می توان از طریق یک سلول تک تک سلولی یا یک نمونه بافت با استفاده از تجزیه و تحلیل بزرگ در مقیاس جهانی شناسایی کرد. با این حال، چنین اندازه گیری های مقیاس بزرگ وقت گیر است. و به دلیل پیچیدگی بالا نمونه فسفوپروتئوم، این روش اغلب قادر به شناسایی سایت های فسفوریلاسیون تنظیم مقادیر کم نیست. متناوبا، تقسیم و تسخیر؟ استراتژی با تحلیل هدفمند زیر مجموعه ای از فسفوپروتئوم، یعنی زیر فسفوپروتئوم، می تواند حساسیت تشخیص این سایت های فسفوریلاسیون را بهبود بخشد. در این بررسی، ما روش های تحلیلی را در این زمینه خلاصه کردیم. رویکردهای غنی سازی برای تجزیه و تحلیل زیر فسفوپروتئومهای تولید شده توسط تیروزین کیناز و بازوفیل کیناز معرفی شدند. استراتژی های تجزیه و تحلیل زیر فسفوپروتئوم های متشکل از فسفوپتید های اندوژن، پپتید های فسفوریلیت شده و غیره نیز مورد بررسی قرار گرفت.
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه شیمی شیمی آنالیزی یا شیمی تجزیه
پیش نمایش مقاله
استراتژی تقسیم و تسخیر برای تجزیه و تحلیل عمیق فسفوپروتومیک
چکیده انگلیسی
With the advance of mass spectrometry based proteomics techniques, thousands of phosphorylation sites can be identified from a single cell line or a single tissue sample by large scale global analysis. However, such large scale analysis is time consuming. And, due to the high complexity of the phosphoproteome sample, this approach is often unable to identify low abundance regulatory phosphorylation sites. Alternatively, the “divide and conquer” strategy by targeted analysis of a subset of phosphoproteome, i.e. subphosphoproteome, can improve the detection sensitivity of these phosphorylation sites. In this review, we summarized the analytical methods in this field. The enrichment approaches for the analysis of subphosphoproteomes generated by tyrosine kinases and basophilic kinases were introduced. The strategies for the analysis of the subphosphoproteomes composed by endogenous phosphopeptides, multiply phosphorylated peptides, etc., were also reviewed.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: TrAC Trends in Analytical Chemistry - Volume 105, August 2018, Pages 282-291
نویسندگان
, , , , ,