کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
8289239 1536301 2016 33 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Neutron protein crystallography: A complementary tool for locating hydrogens in proteins
ترجمه فارسی عنوان
کریستالوگرافی پروتئین نوترون: یک ابزار مکمل برای تعیین محل هیدروژن در پروتئین ها
ترجمه چکیده
کریستالوگرافی پروتئین نوترون یک ابزار قدرتمند برای بررسی پروتئین است زیرا به طور مستقیم موقعیت های هیدروژن را در ساختار پروتئین قرار می دهد. دیدگاه اتمهای هیدروژن و دایتریم ناشی از تعامل قوی نوترون ها با هسته این ایزوتوپ ها است. موقعیت ها می توانند به وضوح از پراکندگی در قطعنامه های متداول کریستال های پروتئینی اختصاص داده شود. نوترونها برای زیست شناسی ساختاری از آسیب تابشی در بلورهای پروتئینی سود بیشتری دارند. همان کریستال را می توان چندین بار برای مطالعات پارامتری اندازه گیری کرد. در اینجا، اصول اساسی کریستالوگرافی پروتئین نوترونی را بررسی می کنیم. اطلاعاتی که می تواند از یک ساختار نوترون بدست آید، در تعادل با ملاحظات عملی ارائه شده است. روش های تولید پروتئین ایزوتوپ جایگزین و رشد بلورهای بزرگ در زمینه ساختارهای نوترونی گزارش شده در ادبیات ارائه شده است. ابزارهای موجود برای جمع آوری داده ها و نرم افزار برای پردازش داده ها و پالایش ساختار همراه با استراتژی های خاص تکنیکی از جمله پالایش ساختاری اشعه ایکس / نوترون شرح داده شده است. در نهایت، نمونه هایی به منظور نشان دادن ارزش علمی منحصر به فرد ساختارهای کریستال پروتون نوترون نشان داده شده است.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی زیست شیمی
چکیده انگلیسی
Neutron protein crystallography is a powerful tool for investigating protein chemistry because it directly locates hydrogen atom positions in a protein structure. The visibility of hydrogen and deuterium atoms arises from the strong interaction of neutrons with the nuclei of these isotopes. Positions can be unambiguously assigned from diffraction at resolutions typical of protein crystals. Neutrons have the additional benefit to structural biology of not inducing radiation damage in protein crystals. The same crystal could be measured multiple times for parametric studies. Here, we review the basic principles of neutron protein crystallography. The information that can be gained from a neutron structure is presented in balance with practical considerations. Methods to produce isotopically-substituted proteins and to grow large crystals are provided in the context of neutron structures reported in the literature. Available instruments for data collection and software for data processing and structure refinement are described along with technique-specific strategies including joint X-ray/neutron structure refinement. Examples are given to illustrate, ultimately, the unique scientific value of neutron protein crystal structures.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Archives of Biochemistry and Biophysics - Volume 602, 15 July 2016, Pages 48-60
نویسندگان
, , ,