کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
8340750 | 1541252 | 2015 | 5 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Detection of mismatched 5-hydroxymethyluracil in DNA by selective chemical labeling
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
5fC5hmUTETBERTET proteins5hmCUDP-GlcTDG5caCDeaminationAPOBEC5mC - 5 سانتی متر5-Hydroxymethyluracil - 5- Hydroxymethyluracil5-formylcytosine - 5-فرمیل سیتوزین5-Methylcytosine - 5-متیل سیتوزین5-hydroxymethylcytosine - 5-هیدروکسی متیل سیتوزین5-carboxylcytosine - 5-کربوکسیلیک سیتوزینDemethylation - demethylationThymine DNA glycosylase - DNA تلقیح گلیکوزیلازβ-Glucosyltransferase - β-گلوکوزیل ترانسفرازbase excision repair - تعمیر پایه پایهten-eleven translocation - ده یازده ترانزیتActivation-induced deaminase - فعال سازی deaminase ناشی ازMeS - مسAID - کمکuridine diphosphoglucose - یدید دی فسفو گلوکز
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شیمی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
How DNA demethylation is achieved in mammals is still under extensive investigation. One proposed mechanism is deamination of 5-hydroxymethylcytosine to form 5-hydroxymethyluracil (5hmU), followed by base excision repair to replace the mismatched 5hmU with cytosine. In this process, 5hmU:G mispair serves as a key intermediate and its localization and distribution in mammalian genome could be important information to investigate the proposed pathway. Here we describe a selective labeling method to map mismatched 5hmU. After converting other cytosine modifications to 5-carboxylcytosines, a biotin tag is installed onto mismatched 5hmU through β-glucosyltransferase-catalyzed glucosylation and click chemistry. The enriched 5hmU-containing DNA fragments can be subject to subsequent sequencing to reveal the distribution of 5hmU:G mispair with base-resolution information acquired.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Methods - Volume 72, 15 January 2015, Pages 16-20
Journal: Methods - Volume 72, 15 January 2015, Pages 16-20
نویسندگان
Miao Yu, Chun-Xiao Song, Chuan He,