کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
8877500 | 1624139 | 2017 | 11 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Rate matrix estimation from site frequency data
ترجمه فارسی عنوان
ارزیابی ماتریس امتیاز از داده های فرکانس سایت
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
چند آلل رایت فیشر، جدا مورن، تکامل عاطفی، ماتریس نرخ تکاملی،
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
علوم کشاورزی و بیولوژیک
علوم کشاورزی و بیولوژیک (عمومی)
چکیده انگلیسی
A procedure is described for estimating evolutionary rate matrices from observed site frequency data. The procedure assumes (1) that the data are obtained from a constant size population evolving according to a stationary Wright-Fisher or decoupled Moran model; (2) that the data consist of a multiple alignment of a moderate number of sequenced genomes drawn randomly from the population; and (3) that within the genome a large number of independent, neutral sites evolving with a common mutation rate matrix can be identified. No restrictions are imposed on the scaled rate matrix other than that the off-diagonal elements are positive, their sum is âª1, and that the rows of the matrix sum to zero. In particular the rate matrix is not assumed to be reversible. The key to the method is an approximate stationary solution to the diffusion limit, forward Kolmogorov equation for neutral evolution in the limit of low mutation rates.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Theoretical Population Biology - Volume 113, February 2017, Pages 23-33
Journal: Theoretical Population Biology - Volume 113, February 2017, Pages 23-33
نویسندگان
Conrad J. Burden, Yurong Tang,