کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
9127108 | 1569970 | 2005 | 9 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Gene expression levels influence amino acid usage and evolutionary rates in endosymbiotic bacteria
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
PHEGLEUCysGLNPHEASNBAPTHRASPBSGBFLTrpEscherichia coli K-12BuchneraWigglesworthiahEG - HEGArg - ارگisoleucine - ایولولینIle - باSER - برای بودنthreonine - ترئونینTryptophan - تریپتوفانBBP - تولید ناخالص داخلیTyr - تیرTyrosine - تیروزینInsects - حشراتHIS - خودval - ساعتSerine - سرینCysteine - سیستئینPhenylalanine - فنیلآلانینLeucine - لوسینLysine - لیزینLYS - لیستMeta - متاMethionine - متیونینMET - ملاقات کردSubstitution rates - نرخ تعویضPRO - نرم افزارhistidine - هیستیدینValine - والینleg - پاProline - پرولینGlu - گلوglutamine - گلوتامینGly - گلیGlycine - گلیسین
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
Most endosymbiotic bacteria have extremely reduced genomes, accelerated evolutionary rates, and strong AT base compositional bias thought to reflect reduced efficacy of selection and increased mutational pressure. Here, we present a comparative study of evolutionary forces shaping five fully sequenced bacterial endosymbionts of insects. The results of this study were three-fold: (i) Stronger conservation of high expression genes at not just nonsynonymous, but also synonymous, sites. (ii) Variation in amino acid usage strongly correlates with GC content and expression level of genes. This pattern is largely explained by greater conservation of high expression genes, leading to their higher GC content. However, we also found indication of selection favoring GC-rich amino acids that contrasts with former studies. (iii) Although the specific nutritional requirements of the insect host are known to affect gene content of endosymbionts, we found no detectable influence on substitution rates, amino acid usage, or codon usage of bacterial genes involved in host nutrition.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Gene - Volume 352, 6 June 2005, Pages 109-117
Journal: Gene - Volume 352, 6 June 2005, Pages 109-117
نویسندگان
Jörg Schaber, Claude Rispe, Jennifer Wernegreen, Andreas Buness, François Delmotte, Francisco J. Silva, Andrés Moya,