کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
9442923 | 1302607 | 2005 | 10 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Eimeria tenella: Identification of secretory and surface proteins from expressed sequence tags
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
TTCPAPEimeria tenellaSRSTRAPTSRRT-PCRMICAMA1EST - استthrombospondin type 1 repeat - ترومبوسپوندن نوع 1 تکرار شودHost–parasite interaction - تعامل میزبان-انگلیExpressed Sequence Tag - تکرار اظهار نظرExpressed sequence tags - تگ های توالی بیان شدهbase pair - جفت پایهIn silico analysis - در تجزیه و تحلیل سیلیکاsequence retrieval system - سیستم بازیابی توالیendoplasmic reticulum - شبکه آندوپلاسمی accession number - شماره ورود، شماره دسترسیphosphatidic acid phosphatase - فسفاتید اسید فسفاتازChicken - مُرغ خانگیApicomplexa - هاگ داران، اپیکامپلکساReverse Transcribed-Polymerase Chain Reaction - واکنش زنجیره ای ترانزیستور معکوس پلیمرازSurface proteins - پروتئین سطحیSecretory proteins - پروتئین های ترشحیThrombospondin-related adhesive protein - پروتئین چسبنده مرتبط با ترومبوسپوندینCoccidia - کوکیدیا
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
ایمنی شناسی و میکروب شناسی
انگل شناسی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
To identify new vaccine candidates, Eimeria tenella expressed sequence tags (ESTs) from public databases were analysed for secretory molecules with an especially developed automated in silico strategy termed DNAsignalP. A total of 12,187 ESTs were clustered into 2881 contigs followed by a blastx search, which resulted in a significant number of E. tenella contigs with homologies to entries in public databases. Amino acid sequences of appropriate homologous proteins were analysed for the occurrence of an N-terminal signal sequence using the algorithm signalP. The resulting list of 84 entries comprised 51 contigs whose deduced proteins showed homologies to proteins of apicomplexan parasites. Based on function or localisation, we selected candidate proteins classified as (i) secreted proteins of Apicomplexa parasites, (ii) secreted enzymes, and (iii) transport and signalling proteins. To verify our strategy experimentally, we used a functional complementation system in yeast. For five selected candidate proteins we found that these were indeed secreted. Our approach thus represents an efficient method to identify secretory and surface proteins out of EST databases.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Experimental Parasitology - Volume 111, Issue 1, September 2005, Pages 14-23
Journal: Experimental Parasitology - Volume 111, Issue 1, September 2005, Pages 14-23
نویسندگان
Christian Klotz, Richard J. Marhöfer, Paul M. Selzer, Richard Lucius, Thomas Pogonka,