کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
10560687 | 969741 | 2011 | 16 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Data processing pipelines for comprehensive profiling of proteomics samples by label-free LC-MS for biomarker discovery
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
PTMHDSSFTMSDDAAMTMRMAPEXETDCIDRSDemPAI - EMLC–MS - LC-MSMS/MS - MS / MSPost translational modification - اصلاح پست ترجمهrelative standard deviation - انحراف استاندارد نسبیElectron transfer dissociation - انحلال انتقال الکترونXML - اکسامالcollision induced dissociation - تقارن ناشی از برخوردextensible markup language - زبان نشانه گذاری توسعه پذیرComputational biology - زیستشناسی محاسباتیMass spectrometry - طیف سنجی جرمیFourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry - طیف سنجی جرمی رزونانس یون سی یونیت تبدیل فوریهMEND - مرمت کردنLabel-free quantification - مقدار کافی تعیین نشدهNano-LC - نانو الکسmultiple reaction monitoring - نظارت چندگانه چندگانهliquid chromatography - کروماتوگرافی مایعliquid chromatography coupled to mass spectrometry - کروماتوگرافی مایع همراه با طیف سنجی جرمیData Dependent Acquisition - کسب وابستگی به داده هاBiomarker discovery - کشف بیومارکر
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
شیمی
شیمی آنالیزی یا شیمی تجزیه
پیش نمایش صفحه اول مقاله
![عکس صفحه اول مقاله: Data processing pipelines for comprehensive profiling of proteomics samples by label-free LC-MS for biomarker discovery Data processing pipelines for comprehensive profiling of proteomics samples by label-free LC-MS for biomarker discovery](/preview/png/10560687.png)
چکیده انگلیسی
Label-free quantitative LC-MS profiling of complex body fluids has become an important analytical tool for biomarker and biological knowledge discovery in the past decade. Accurate processing, statistical analysis and validation of acquired data diversified by the different types of mass spectrometers, mass spectrometer parameter settings and applied sample preparation steps are essential to answer complex life science research questions and understand the molecular mechanism of disease onset and developments. This review provides insight into the main modules of label-free data processing pipelines with statistical analysis and validation and discusses recent developments. Special emphasis is devoted to quality control methods, performance assessment of complete workflows and algorithms of individual modules. Finally, the review discusses the current state and trends in high throughput data processing and analysis solutions for users with little bioinformatics knowledge.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Talanta - Volume 83, Issue 4, 30 January 2011, Pages 1209-1224
Journal: Talanta - Volume 83, Issue 4, 30 January 2011, Pages 1209-1224
نویسندگان
Christin Christin, Rainer Bischoff, Péter Horvatovich,