کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
1947131 | 1054297 | 2007 | 10 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
The KH and S1 domains of Escherichia coli polynucleotide phosphorylase are necessary for autoregulation and growth at low temperature
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
ADPRNA-binding domainsSix-histidine tagPNPasec.f.u.PMSFPAGEkDaSDSRPMDTTIPTGAminoacids - آمینو اسیدEDTA - اتیلن دی آمین تترا استیک اسید Ethylenediaminetetraacetic acid - اتیلینیدامین تتراستیک اسیدpolyacrylamide gel electrophoresis - الکتروفورز ژل پلی آکریل آمیدisopropyl-beta-d-thiogalactopyranoside - ایزوپروپیل بتا-دی-تیوگالاکتپیرانوزیدprotein aggregation - تجمع پروتئینDissociation constant - حد تفکیکMichaelis–Menten constant - دائمی Michaelis-Mentendithiothreitol - دیتیوتریتولCold adaptation - سازگاری سردsodium lauryl sulfate - سدیم لوریل سولفاتinorganic phosphate - فسفات معدنیPolynucleotide phosphorylase - فسفوریلاس پولینوکلئوتیدPhenylmethylsulphonylfluoride - فنیل متیل سولفونیل فلورایدcolony forming units - واحدهای تشکیل دهنده کلنیoptical density - چگالی نوریkilo Daltons - کیلوگرم دالتون
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شیمی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
PNPase is a phosphate-dependent exonuclease of Escherichia coli required for growth in the cold. In this work we explored the effect of specific mutations in its two RNA binding domains KH and S1 on RNA binding, enzymatic activities, autoregulation and ability to grow at low temperature. We removed critical motifs that stabilize the hydrophobic core of each domain, as well as made a complete deletion of both (ÎKHS1) that severely impaired PNPase binding to RNA. Nevertheless, a residual RNA binding activity, possibly imputable to catalytic binding, could be observed even in the ÎKHS1 PNPase. These mutations also resulted in significant changes in the kinetic behavior of both phosphorolysis and polymerization activities of the enzyme, in particular for the double mutant Pnp-ÎKHS1-H. Additionally, PNPases with mutations in these RNA binding domains did not autoregulate efficiently and were unable to complement the growth defect of a chromosomal Îpnp mutation at 18 °C. Based on these results it appears that in E. coli the RNA binding domains of PNPase, in particular the KH domain, are vital at low temperature, when the stem-loop structures present in the target mRNAs are more stable and a machinery capable to degrade structured RNA may be essential.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Structure and Expression - Volume 1769, Issue 3, March 2007, Pages 194-203
Journal: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Structure and Expression - Volume 1769, Issue 3, March 2007, Pages 194-203
نویسندگان
Maura EpifanÃa Matus-Ortega, Maria Elena Regonesi, Alberto Piña-Escobedo, Paolo Tortora, Gianni Dehò, Jaime GarcÃa-Mena,