کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
24422 | 43514 | 2009 | 5 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
CLUSEAN: A computer-based framework for the automated analysis of bacterial secondary metabolite biosynthetic gene clusters
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
مهندسی شیمی
بیو مهندسی (مهندسی زیستی)
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
Bacterial secondary metabolites are an important source of antimicrobial and cytostatic drugs. These molecules are often synthesized in a stepwise fashion by multimodular megaenzymes that are encoded in clusters of genes encoding enzymes for precursor supply and modification.In this work, we present an open source software pipeline, CLUSEAN (CLUster SEquence ANalyzer) that helps to annotate and analyze such gene clusters. CLUSEAN integrates standard analysis tools, like BLAST and HMMer, with specific tools for the identification of the functional domains and motifs in nonribosomal peptide synthetases (NRPS)/type I polyketide synthases (PKS) and the prediction of specificities of NRPS.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Biotechnology - Volume 140, Issues 1–2, 10 March 2009, Pages 13–17
Journal: Journal of Biotechnology - Volume 140, Issues 1–2, 10 March 2009, Pages 13–17
نویسندگان
T. Weber, C. Rausch, P. Lopez, I. Hoof, V. Gaykova, D.H. Huson, W. Wohlleben,