کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5905097 | 1159829 | 2016 | 35 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Identification and expression analysis of cellular and viral microRNAs in CyHV3-infected KCF-1 cells
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
rRNAVZVsnoRNAsnRNATBEDPIddH2OtRNAUVBNCBICyHV-3Dulbecco minimum essential mediumLPSDMEMultraviolet radiation BKHVMCPcDNA - cDNADNA - DNA یا اسید دزوکسی ریبونوکلئیکESTs - EST هاMOI - MERibosomal RNA - RNA Ribosomalsmall nuclear RNA - RNA هسته ای کوچکsmall RNA - RNA کوچکsmall nucleolar RNA - RNA کوچک هسته ایdouble distilled water - آب دوتاییEDTA - اتیلن دی آمین تترا استیک اسید Ethylenediaminetetraacetic acid - اتیلینیدامین تتراستیک اسیدtransfer RNA - انتقال RNAExpressed sequence tags - تگ های توالی بیان شدهbase pair - جفت پایهdigoxigenin - دیگوکسین ژنreverse transcription - رونویسی معکوسmicroRNAs - ریز آرانایSRNA - سرناDIG - شماViral infection - عفونت ویروسیlipopolysaccharide - لیپوپلی ساکاریدNational Center of Biotechnology Information - مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژیUntranslated regions - مناطق غیر ترجمهUTR یا untranslated regions - منطقه ترجمه نشدهMicroRNA - میکرو RNA MiRNA - میکروRNA، ریزآرانای، miRNANucleotides - نوکلئوتیدpolymerase chain reaction - واکنش زنجیره ای پلیمرازPCR - واکنش زنجیرهٔ پلیمرازCyprinid herpesvirus-3 - ویروس تبخال 3Varicella zoster virus - ویروس واریسلا زوسترKoi herpesvirus - ویروس کویmajor capsid protein - پروتئین کپسید اصلیmultiplicity of infection - چندین عفونتCommon carp - کپور معمولی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
MicroRNAs (miRNAs) are small non-coding RNAs with approximately 22 nucleotides (nt) that are encoded by a diverse range of metazoan eukaryotes, plants and viruses. CyHV-3 (cyprinid herpesvirus-3) is a member of the Alloherpesviridae virus family and has caused severe economic losses for the common carp and koi carp fishery industries. In this study, a total of 15,987,652 clean reads were generated from a cDNA library of CyHV-3-infected KCF-1 (koi caudal fin) cells using high-throughput sequencing technology. Following annotation and secondary structure prediction, 28 miRNAs were identified as novel candidate miRNAs encoded by common carp (Cyprinus carpio), and seven miRNAs were shown to be encoded by CyHV-3. Next, 19 host miRNAs and seven viral miRNAs were validated by stem-loop real-time PCR. Northern blot analysis confirmed the presence of 14 host miRNAs and five CyHV-3-encoded novel miRNAs. The results of this study expand the knowledge of common carp and CyHV-3 microRNAs and provide a useful theoretical foundation for further study of CyHV-3.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Gene - Volume 592, Issue 1, 30 October 2016, Pages 154-163
Journal: Gene - Volume 592, Issue 1, 30 October 2016, Pages 154-163
نویسندگان
Xuezhu Lee, Shaoping Weng, Gang Dong, Hetong Zhang, Jie Zeng, Jianguo He, Chuanfu Dong,