کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
6487184 1377 2013 11 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Computational investigations of folded self-avoiding walks related to protein folding
ترجمه فارسی عنوان
بررسی های محاسباتی از پیاده سازی های خودمحکومت شده در ارتباط با تاخیر پروتئین
کلمات کلیدی
خود را اجتناب از پیاده روی، پروتئین تاشو، پیش بینی ساختار پروتئین،
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه مهندسی شیمی بیو مهندسی (مهندسی زیستی)
چکیده انگلیسی
Various subsets of self-avoiding walks naturally appear when investigating existing methods designed to predict the 3D conformation of a protein of interest. Two such subsets, namely the folded and the unfoldable self-avoiding walks, are studied computationally in this article. We show that these two sets are equal and correspond to the whole n-step self-avoiding walks for n ≤ 14, but that they are different for numerous n ≥ 108, which are common protein lengths. Concrete counterexamples are provided and the computational methods used to discover them are completely detailed. A tool for studying these subsets of walks related to both pivot moves and protein conformations is finally presented.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Computational Biology and Chemistry - Volume 47, December 2013, Pages 246-256
نویسندگان
, , , ,