کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
8340554 | 1541240 | 2015 | 9 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Defining bacterial regulons using ChIP-seq
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شیمی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
Chromatin immunoprecipitation followed by high-throughput sequencing (ChIP-seq) is a powerful method that identifies protein-DNA binding sites in vivo. Recent studies have illustrated the value of ChIP-seq in studying transcription factor binding in various bacterial species under a variety of growth conditions. These results show that in addition to identifying binding sites, correlation of ChIP-seq data with expression data can reveal important information about bacterial regulons and regulatory networks. In this chapter, we provide an overview of the current state of knowledge about ChIP-seq methodology in bacteria, from sample preparation to raw data analysis. We also describe visualization and various bioinformatic analyses of processed ChIP-seq data.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Methods - Volume 86, 15 September 2015, Pages 80-88
Journal: Methods - Volume 86, 15 September 2015, Pages 80-88
نویسندگان
Kevin S. Myers, Dan M. Park, Nicole A. Beauchene, Patricia J. Kiley,