کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
8358987 1542172 2015 24 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Tracking the metabolic pulse of plant lipid production with isotopic labeling and flux analyses: Past, present and future
ترجمه فارسی عنوان
ردیابی پالس متابولیک تولید لیپید گیاه با برچسب زدایی از ایزوتوپ و تجزیه و تحلیل شار: گذشته، حال و آینده
کلمات کلیدی
تجزیه و تحلیل شار متابولیک، برچسب زدن با ایزوتوپ، ویرایش آکیل، متابولیسم مرکزی، طیف سنجی جرمی،
ترجمه چکیده
متابولیسم شامل شبکه هایی از تغییرات شیمیایی است که به مسیرهای بیوشیمیایی یکپارچه متصل شده اند که پایه سلولی هستند و عملکرد آنها برای حفظ زندگی است. متابولیسم و ​​بنابراین زندگی، استاتیک نیست. میزان متابولیت های انتقال از راه های بیوشیمیایی (یعنی شار) فنوتایپ های سلولی را تعیین می کند و به طور مداوم در پاسخ به درگیری های ژنتیکی یا محیطی تغییر می کند. هر تغییری پاسخی را در جریان مسیر متابولیک ایجاد می کند و مقدار کوانتومی تحت شرایط متنوع به توضیح مسیرهای عمده و جزئی و جنبه های نظارتی متابولیسم کمک می کند. برای اندازه گیری فلو مورد نیاز روش های تجربی است که جنبش ها و تحولات متابولیت ها را بدون ایجاد مصنوعات ارزیابی می کند. برچسب زدن به ایزوتوپها این نقش را پر می کند و یک رویکرد آزمایشی طولانی مدت برای شناسایی مسیرها و تعیین میزان ارتباط متابولیک آنها در بافت های مختلف و یا تحت شرایط مختلف است. استفاده از تکنیک های برچسب زدن به علم گیاهان تا حد زیادی از رسیدن به آن پتانسیل است. با توجه به پیشرفت های ژنتیک و زیست شناسی مولکولی که وسیله ای برای تغییر متابولیسم هستند و با توجه به پیشرفت های اخیر در ابزار دقیق، ابزار محاسباتی و ایزوتوپ های موجود، استفاده از برچسب های ایزوتوپ برای متابولیسم پروب در حال افزایش است. ما روشهای اصلی تحلیلی برای برچسب زدن ایزوتوپ را با تمرکز بر مطالعات مشتق از مسیرها و جریانهای متابولیسم لیپید و پراکندگی کربن از طریق متابولیسم مرکزی بررسی می کنیم. مراحل متابولیک کربن مرکزی به طور مستقیم به تولید چربی کمک می کند تا بتواند پیش سازهای بیوسنتز اسید های چرب و ترشحات چربی تولید کند. علاوه بر این، برخی از ایده ها برای تکنیک های برچسب گذاری که ممکن است بیشتر برای متابولیسم لیپید در آینده مورد استفاده قرار گیرد، در اصل برای بررسی سایر جنبه های متابولیسم مرکزی ایجاد شده است. ما با توصیف پیشرفت های اخیر که نقش آتی مهم در تعیین مقدار شار و متابولیسم در بافت گیاه را نشان می دهد، نتیجه گیری می شود.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری علوم کشاورزی و بیولوژیک دانش تغذیه
چکیده انگلیسی
Metabolism is comprised of networks of chemical transformations, organized into integrated biochemical pathways that are the basis of cellular operation, and function to sustain life. Metabolism, and thus life, is not static. The rate of metabolites transitioning through biochemical pathways (i.e., flux) determines cellular phenotypes, and is constantly changing in response to genetic or environmental perturbations. Each change evokes a response in metabolic pathway flow, and the quantification of fluxes under varied conditions helps to elucidate major and minor routes, and regulatory aspects of metabolism. To measure fluxes requires experimental methods that assess the movements and transformations of metabolites without creating artifacts. Isotopic labeling fills this role and is a long-standing experimental approach to identify pathways and quantify their metabolic relevance in different tissues or under different conditions. The application of labeling techniques to plant science is however far from reaching it potential. In light of advances in genetics and molecular biology that provide a means to alter metabolism, and given recent improvements in instrumentation, computational tools and available isotopes, the use of isotopic labeling to probe metabolism is becoming more and more powerful. We review the principal analytical methods for isotopic labeling with a focus on seminal studies of pathways and fluxes in lipid metabolism and carbon partitioning through central metabolism. Central carbon metabolic steps are directly linked to lipid production by serving to generate the precursors for fatty acid biosynthesis and lipid assembly. Additionally some of the ideas for labeling techniques that may be most applicable for lipid metabolism in the future were originally developed to investigate other aspects of central metabolism. We conclude by describing recent advances that will play an important future role in quantifying flux and metabolic operation in plant tissues.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Progress in Lipid Research - Volume 58, April 2015, Pages 97-120
نویسندگان
, , ,