کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
8644558 | 1569762 | 2018 | 27 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
The chrysanthemum leaf and root transcript profiling in response to salinity stress
ترجمه فارسی عنوان
پروفیل برگ و ریشه در پاسخ به تنش شوری
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
ABAPODFPKMDTGsqRT-PCRCATFDRAPXCoGROS - ROSabscisic acid - اسید آبسزیکSalt stress - تنش شوریclusters of orthologous groups - خوشه های گروه های ارتوقیKEGG یا Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes - دایرة المعارف ژن ها و ژنوم کیوتو Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes - دایره المعارف ژنتیک ژن ها و ژنوم کیوتوSOD - سدSuperoxide dismutase - سوکسوکس دیسموتازfalse discovery rate - میزان کشف کاذبGene ontology - هستیشناسی ژنیquantitative real-time PCR - واکنش زنجیره ای پلیمراز واقعی در زمان واقعیnon-redundant database - پایگاه داده غیر انحصاریPeroxidase - پراکسیدازascorbate peroxidase - پراکسیداز آسکورباتیCatalase - کاتالازChrysanthemum morifolium - گل داودی موری فلیومglutathione reductase - گلوتاتیون ردوکتازReactive oxygen species - گونههای فعال اکسیژن
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
چکیده انگلیسی
RNA-Seq was applied to capture the transcriptome of the leaf and root of non-treated and salinity-treated chrysanthemum cv. 'Jinba' plants. A total of 206,868 unigenes of mean length 849â¯nt and of N50 length 1363â¯nt was identified; of these about 64% (>â¯132,000) could be functionally assigned. Depending on the severity of the salinity stress, differential transcription was observed for genes encoding proteins involved in osmotic adjustment, in ion transport, in reactive oxygen species scavenging and in the regulation of abscisic acid (ABA) signaling. The root stress response was dominated by the up-regulation of genes involved in ion transport, while that of the leaf reflected the plant's effort to make osmotic adjustments and to regulate Ca2+ transport. An array of known transcription factors (WRKY, AP2/ERF, MYB, bHLH and NAC) were differentially transcribed.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Gene - Volume 674, 20 October 2018, Pages 161-169
Journal: Gene - Volume 674, 20 October 2018, Pages 161-169
نویسندگان
Peilei Cheng, Jiaojiao Gao, Yitong Feng, Zixin Zhang, Yanan Liu, Weimin Fang, Sumei Chen, Fadi Chen, Jiafu Jiang,