کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
8645617 | 1569790 | 2018 | 12 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Transcriptomic analysis of topping-induced axillary shoot outgrowth in Nicotiana tabacum
ترجمه فارسی عنوان
تجزیه و تحلیل ترانسکتیکومیک رشد ساقه زیر بغل ناشی از سرگیجه در نیکوتیانا توباگووم
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
SPSRPKMGH3TIR1ARFM-MLVSSHSPPTPsDEGsCRE1AUX1UGPTrehalose phosphate synthasePDCFDRIAAN. tabacumABATPP6-Phosphofructokinase - 6-فسفوفروتکتینازabscisic acid - اسید آبسزیکAuxin - اکسینReads per kilobase per million mapped reads - به ازای هر کیلو بایت خوانده شده در هر کیلو بایت خوانده می شودKEGG یا Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes - دایرة المعارف ژن ها و ژنوم کیوتو Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes - دایره المعارف ژنتیک ژن ها و ژنوم کیوتوSucrose phosphate synthase - سداز فسفات سروزsucrose-6-phosphate - سقز -6-فسفاتSucrose synthase - سنتاز ساکاروزcytokinin - سیتوکینینAuxin response factor - فاکتور پاسخ اکسینAHP - فرایند تحلیل سلسلهمراتبیSugars - قند یا شکرfalse discovery rate - میزان کشف کاذبStarch phosphorylase - نشاسته فسفریلاسAux/IAA - های AUX / IAAGene ontology - هستیشناسی ژنیSuppression subtractive hybridization - هیبریداسیون تفکیک پذیری سرکوبMoloney murine leukemia virus - ویروس لوئی موش MoloneyTransport inhibitor response 1 - پاسخ مهار کننده حمل و نقل 1pyruvate dehydrogenase complex - پیرووات دهیدروژناز پیچیدهpyruvate kinase - پیرووات کینازDifferentially expressed genes - ژن های متفاوت بیان شده استNicotiana tabacum - گل توتونGibberellin - گیببرلین
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
چکیده انگلیسی
Topping is an important agronomic practice that significantly impacts the yield of various crop plants. Topping and the regulation of axillary shoot outgrowth are common agronomic practices in tobacco. However, the effects of topping on gene expression in tobacco remain unknown. We applied the Illumina HiSeq⢠2000 platform and analyzed differentially expressed genes (DEGs) from untopped and topped plants to study the global changes in gene expression in response to topping. We found that the number of DEGs varied from 7609 to 18,770 based on the reads per kilobase per million mapped reads (RPKM) values. The Gene Ontology (GO) enrichment analysis revealed that the cellular carbohydrate metabolic process and the disaccharide metabolic process, which may contribute to starch accumulation and stress/defense, were overrepresented terms for the DEGs. Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) analysis revealed that many DEGs were involved in starch and sucrose metabolism, glycolysis/gluconeogenesis, pyruvate metabolism, and plant hormone signal transduction, among other processes. The knowledge gained will improve our understanding of the processes of axillary shoot formation and enlargement at the transcriptional level. This study lays a solid foundation for future studies on molecular mechanisms underlying the growth of axillary shoots.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Gene - Volume 646, 10 March 2018, Pages 169-180
Journal: Gene - Volume 646, 10 March 2018, Pages 169-180
نویسندگان
Wei-feng Wang, Peng Chen, Jing Lv, Lei Chen, Yu-he Sun,