کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
8646360 | 1570094 | 2017 | 8 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Analysis of genetic association using hierarchical clustering and cluster validation indices
ترجمه فارسی عنوان
تجزیه و تحلیل ارتباط ژنتیکی با استفاده از خوشه بندی سلسله مراتبی و شاخص اعتبار سنجی خوشه
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
ژنومیکس، خوشه بندی اتحادیه، شاخص های اعتبار سنجی،
ترجمه چکیده
در این کار، ما یک روش برای پیدا کردن مجموعه ژن های هم بیان شده، بر اساس شاخص اعتبارسنجی خوشه به عنوان یک اندازه گیری از شباهت برای گروه های ژن فردی، و ترکیبی از انواع خوشه بندی سلسله مراتبی برای تولید گروه های نامزد پیشنهاد شده است. ما توانایی آن را برای بازیابی مجموعه های قابل توجه در داده های همبسته و واقعی ژنومیک، که در آن عملکرد بر اساس توانایی تشخیص مجموعه های همگرا تنظیم شده در برابر جستجوی کامل اندازه گیری شده است، ارزیابی کردیم. علاوه بر این، ما کیفیت بهترین گروه های رتبه بندی شده با استفاده از ابزار بیوانفورماتیک آنلاین که اطلاعات شبکه را برای ژن های انتخابی فراهم می کند، مورد تجزیه و تحلیل قرار دادیم.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
چکیده انگلیسی
In this work, we propose a method to find sets of co-expressed genes, based on cluster validation indices as a measure of similarity for individual gene groups, and a combination of variants of hierarchical clustering to generate the candidate groups. We evaluated its ability to retrieve significant sets on simulated correlated and real genomics data, where the performance is measured based on its detection ability of co-regulated sets against a full search. Additionally, we analyzed the quality of the best ranked groups using an online bioinformatics tool that provides network information for the selected genes.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Genomics - Volume 109, Issues 5â6, October 2017, Pages 438-445
Journal: Genomics - Volume 109, Issues 5â6, October 2017, Pages 438-445
نویسندگان
Inti A. Pagnuco, Juan I. Pastore, Guillermo Abras, Marcel Brun, Virginia L. Ballarin,