On the decidability of population size histories from finite allele frequency spectra

درک وقایع تاریخی که تنوع ژنتیکی فعلی را شکل داده اند، کاربردی در تحقیقات تاریخی، بیولوژیکی و پزشکی دارد. با این حال، مقدار اطلاعات تاریخی که می تواند از داده های ژنتیکی حاصل شود، محدود است، که منجر به یک مشکل شناسایی می شود. به عنوان مثال، فرآیندهای تاریخی مختلف می توانند منجر به توزیع یکسان از فراوانی آلل شوند. این مسئله شناسایی، سایه عدم اطمینان را بر نتایج هر مطالعه ای که از طیف فراوانی برای به دست آوردن جمعیت شناسی گذشته استفاده می کند، ایجاد می کند. استدلال شده است که تحمیل محدودیت های "معقولیت" خفیف بر تاریخ های جمعیت شناختی می تواند بازسازی منحصر به فرد را حداقل در یک محیط آرمانی که طول آن ژنوم تقریبا بی نهایت است را قادر می سازد. در اینجا ما برای این مسئله برای اندازه نمونه محدود و طول ژنوم بحث می کنیم. با استفاده از تقریب نفوذ، محدوده های احتمال تفاوت بین تاریخ های جمعیتی مشابه را به دست می آوریم و از آنها برای ساخت جفت تاریخ های منطقی بسیار متفاوت که توزیع فرکانس تقریبا یکسان را تولید می کنند استفاده می کنیم. بنابراین مسئله ژنوم محدود باقی ماندن ضعیف حتی در میان تاریخچه های معقول نیز ثابت می شود. به جای مدل های چند پارامتر، فواصل اطمینان پارامترهای باریک تولید می کنند، عدم قطعیت های بزرگ پنهان شده بر اساس مدل فرض می شود.