دانلود مقالات ISI درباره مدل سازی همگرا + ترجمه فارسی

A computational design approach for virtual screening of peptide interactions across K+ channel families

Keywords: مدل سازی همگرا; Homology modeling; Computational docking; Virtual screening; Ion channels; Venom peptides; Protein–protein interactions

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Molecular characterization, modeling and docking of CYP107CB2 from Bacillus lehensis G1, an alkaliphile

Keywords: مدل سازی همگرا; Cytochrome P450 monooxygenase; 1α,25-dihydroxyvitamin D3; Bacillus lehensis G1; Homology modeling; Molecular docking

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

What can we learn from molecular dynamics simulations for GPCR drug design?

Keywords: مدل سازی همگرا; Molecular dynamics simulations; GPCR; Homology modeling; Water network; CC chemokine receptor 3; Muscarinic acetylcholine receptor 3

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Glandular β-glucosidases in juvenile Chrysomelina leaf beetles support the evolution of a host-plant-dependent chemical defense

Keywords: مدل سازی همگرا; Insect; β-Glucosidase; Enzyme kinetics; RNA interference; Homology modeling; Evolution;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Understanding of real alternative redox partner of Streptomyces peucetius DoxA: Prediction and validation using in silico and in vitro analyses

Keywords: مدل سازی همگرا; Cytochrome P450; Electron-transport system; Homology modeling; In silico analysis; Streptomyces peucetius ATCC27952

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

A computational chemistry perspective on the current status and future direction of hepatitis B antiviral drug discovery

Keywords: مدل سازی همگرا; Hepatitis B virus; Computational chemical biology; Homology modeling; Molecular docking; Molecular dynamics; Bioinformatics

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

A refined atomic scale model of the Saccharomyces cerevisiae K+-translocation protein Trk1p combined with experimental evidence confirms the role of selectivity filter glycines and other key residues

Keywords: مدل سازی همگرا; K+-translocation; Eukaryotic Trk; Saccharomyces cerevisiae; Homology modeling; Molecular dynamics; Selectivity filter;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 13 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Rational design of stable and functional hirudin III mutants with lower antigenicity

Keywords: مدل سازی همگرا; Hirudin; Antigenicity; Deimmunization; Homology modeling; Structure-function analysis; Molecular dynamics simulation;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 13 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Structural modeling and patch-clamp analysis of pain-related mutation TRPA1-N855S reveal inter-subunit salt bridges stabilizing the channel open state

Keywords: مدل سازی همگرا; Ankyrin receptor subtype 1; Transient receptor potential; S4-S5-linker; Mutagenesis; Homology modeling; Molecular dynamics; AITC; allyl isothiocyanate; CA; cinnamaldehyde; HEK293T cell; human embryonic kidney-293 cell expressing the large T-antigen of S

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 14 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

A facile and novel synthesis of N2-, C6-substituted pyrazolo[3,4-d]pyrimidine-4 carboxylate derivatives as adenosine receptor antagonists

Keywords: مدل سازی همگرا; Pyrazolo[3,4-d]pyrimidine; Carboxylate derivatives; Adenosine receptor antagonists; Homology modeling; Molecular docking; Structure-affinity relationshiphA3AR, human A3 adenosine receptor; SAR, structure-activity relationship; PTP, pyrazolo[4,3-e]1,2,4-tr

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 15 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Structural and functional analyses of Barth syndrome-causing mutations and alternative splicing in the tafazzin acyltransferase domain

Keywords: مدل سازی همگرا; TAZ gene; X-linked recessive disease; Disease-causing mutations; Homology modeling; Immunodeficiency; Intrinsically unstructured region

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 15 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Constructing an atomic-resolution model of human P2X7 receptor followed by pharmacophore modeling to identify potential inhibitors

Keywords: مدل سازی همگرا; P2X7 receptor antagonists; Pharmacophore model; Virtual screening; Homology modeling; Molecular dynamics simulation; Molecular docking

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 19 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Binding site identification and role of permanent water molecule of PIM-3 kinase: A molecular dynamics study

Keywords: مدل سازی همگرا; PIM 3 kinase; Homology modeling; MODELLER software; Ramachandran plot,; AutoDock; AMBER;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 19 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Homology modeling, functional annotation and comparative genomics of outer membrane protein H of Pasteurella multocida

Keywords: مدل سازی همگرا; 3D; Three dimensional; BLAST; Basic Local Alignment Search Tool; BLASTp; Protein-BLAST; CDD; Conserved Domains Database; Da; Dalton; DEG; Database of Essential Genes; GO; Gene Ontology; GRAVY; Grand Average of Hydropathy; KAAS; KEGG automatic annotation s

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 29 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Molecular modeling and docking study on dopamine D2-like and serotonin 5-HT2A receptors

Keywords: مدل سازی همگرا; Dopamine receptor; 5-Hydroxytryptamine receptor; Homology modeling; Molecular dynamics; Docking;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 31 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Cross talk between Leishmania donovani CpG DNA and Toll-like receptor 9: An immunoinformatics approach

Keywords: مدل سازی همگرا; Toll-like receptor; Immune response; PAMPs; Homology modeling; Parasitic infection;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 32 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

In silico and experimental validation of protein-protein interactions between PknI and Rv2159c from Mycobacterium tuberculosis

Keywords: مدل سازی همگرا; Protein-protein interaction; PknI; Homology modeling; Protein docking; Molecular dynamics; Binding free energy;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 38 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

In vitro assessment of allergenicity features and localization of probable IgE binding regions

Keywords: مدل سازی همگرا; B-cell epitopes; Food allergen; Rice (Oryza sativa); Chitinase; Homology modeling; in silico tools;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 50 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Structural models of mammalian mitochondrial transcription factor B2

Keywords: مدل سازی همگرا; Mitochondria; Transcription; TFB2M; TFAM; POLRMT; Homology modeling; SAXS;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 57 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Study of the residues involved in the binding of β1 to β3 subunits in the sodium channel

Keywords: مدل سازی همگرا; Sodium channel; β subunit; Homology modeling;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 5 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Naturally occurring N6-substituted adenosines (cytokinin ribosides) are in vitro inhibitors of platelet aggregation: An in silico evaluation of their interaction with the P2Y12 receptor

Keywords: مدل سازی همگرا; Cytokinin ribosides; Platelets; Anti-aggregation activity; P2Y12 receptor; Homology modeling; Molecular docking;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

In silico study of 1-(4-Phenylpiperazin-1-yl)-2-(1H-pyrazol-1-yl) ethanones derivatives as CCR1 antagonist: Homology modeling, docking and 3D-QSAR approach

Keywords: مدل سازی همگرا; CCR1; 3D-QSAR; Homology modeling; Receptor-guided CoMFA; Docking;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Homology modeling and docking studies of BjGL, a novel (+) gamma-lactamase from Bradyrhizobium japonicum

Keywords: مدل سازی همگرا; Homology modeling; (+) Gamma-lactamases; Molecular docking; BjGL; Enantioselective hydrolysis

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Lessons from molecular modeling human α-l-iduronidase

Keywords: مدل سازی همگرا; Homology modeling; Low identity template; α-l-Iduronidase (IDUA); Model evaluation tools; Molecular dynamics; Secondary structure assessment;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Expression, characterization and homology modeling of a novel eukaryotic GH84 β-N-acetylglucosaminidase from Penicillium chrysogenum

Keywords: مدل سازی همگرا; β-N-acetylglucosaminidase; Homology modeling; O-GlcNAcase; Pichia pastoris; Yeast expression system;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Synthesis and biological evaluation of pyrido[2,3-d]pyrimidine-2,4-dione derivatives as eEF-2K inhibitors

Keywords: مدل سازی همگرا; eEF-2K, eukaryotic elongation factor-2 kinase; 2-DOG, 2-deoxy-d-glucose; DMF, dimethylformamide; DMSO, dimethylsulfoxidePyrido[2,3-d]pyrimidine-2,4-dione; Uracil; eEF-2K inhibitor; Kinase inhibitor; Homology modeling

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Cloning and characterization of a galactitol 2-dehydrogenase from Rhizobium legumenosarum and its application in d-tagatose production

Keywords: مدل سازی همگرا; Galactitol 2-dehydrogenase; Sugar alcohols; SDR enzyme; Homology modeling

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Toward activated homology models of the human M1 muscarinic acetylcholine receptor

Keywords: مدل سازی همگرا; G protein-coupled receptor; Homology modeling; Docking; Virtual screening; Activated structure

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Caffeic acid O-methyltransferase from Leucaena leucocephala: Cloning, expression, characterization and molecular docking analyses

Keywords: مدل سازی همگرا; O-methyl transferase; Homology modeling; Leucaena leucocephala; Molecular docking; Phylogenetic analysis

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Structural studies, homology modeling and molecular docking of novel non-competitive antagonists of GluK1/GluK2 receptors

Keywords: مدل سازی همگرا; Homology modeling; Indole derivatives; Kainate receptors; Molecular docking; X-ray structure determination

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Functional mapping and implications of substrate specificity of the yeast high-affinity leucine permease Bap2

Keywords: مدل سازی همگرا; Saccharomyces cerevisiae; Leucine permease Bap2; Homology modeling; logP;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Discovery of novel anti-leishmanial agents targeting LdLip3 lipase

Keywords: مدل سازی همگرا; Leishmaniasis; Lipase; Lipid metabolism; Structure-based drug discovery; Homology modeling; Virtual screening

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Discovery of simplified N2-substituted pyrazolo[3,4-d]pyrimidine derivatives as novel adenosine receptor antagonists: Efficient synthetic approaches, biological evaluations and molecular docking studies

Keywords: مدل سازی همگرا; Pyrazolo[3,4-d]pyrimidine; Adenosine receptor antagonist; Homology modeling; Molecular docking; Structure affinity relationship;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 15 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Structure and putative signaling mechanism of Protease activated receptor 2 (PAR2) – A promising target for breast cancer

Keywords: مدل سازی همگرا; Homology modeling; Binding affinity; Endogenous ligands; Agonist; Antagonist

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 21 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

QM-polarized ligand docking accurately predicts the trend in binding affinity of a series of arylmethylene quinuclidine-like derivatives at the α4β2 and α3β4 nicotinic acetylcholine receptors (nAChRs)

Keywords: مدل سازی همگرا; ACHBP; acetylcholine-binding protein; Ach; acetylcholine; CNS; central nervous system; MEC; minimum-effective concentration; nAChR; nicotinic acetylcholine receptor; NIC; nicotine; Pdb; protein databank; rmsd; root-mean-squared-deviation; ROC; receiver op

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Pharmacological properties and predicted binding mode of arylmethylene quinuclidine-like derivatives at the α3β4 nicotinic acetylcholine receptor (nAChR)

Keywords: مدل سازی همگرا; ACHBP; acetylcholine-binding protein; Ach; acetylcholine; CNS; central nervous system; MEC; minimum-effective concentration; nAChR; nicotinic acetylcholine receptor; NIC; nicotine; Pdb; protein databank; rmsd; root-mean-squared-deviation; ROC; receiver op

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Molecular modeling of Acetyl-CoA carboxylase (ACC) from Jatropha curcas and virtual screening for identification of inhibitors

Keywords: مدل سازی همگرا; Acetyl-CoA carboxylase (ACC); Jatropha curcas; Fatty acid biosynthesis; Homology modeling; Molecular docking;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Probing the active site of cinnamoyl CoA reductase 1 (Ll-CCRH1) from Leucaena leucocephala

Keywords: مدل سازی همگرا; Ll-CCRH1; Leucaena leucocephala cinnamoyl CoA reductase 1; Pg; phenylglyoxal; NAI; N-acetyl imidazole; CA; citraconic acid; PMSF; phenylmethylsulfonyl fluoride; DEPC; diethylpyrocarbonate; WRK; Woodward's reagent K; NEM; N-ethylmaleimide; pHMB; p-hydroxym

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

In silico investigations on HSP90 and its inhibition for the therapeutic prevention of breast cancer

Keywords: مدل سازی همگرا; HSP90; Homology modeling; Protein-protein docking; Protein-ligand docking; 17-DMAG;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Role of a highly conserved proline-126 in ThDP binding of Mycobacterium tuberculosis acetohydroxyacid synthase

Keywords: مدل سازی همگرا; Acetohydroxyacid synthase; ThDP dependent enzyme; ThDP binding; Mutagenesis; Homology modeling;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Heterologous expression and characterization of a novel thermo-halotolerant endoglucanase Cel5H from Dictyoglomus thermophilum

Keywords: مدل سازی همگرا; Endoglucanase; Thermostability; Halo-tolerance; Cellulose binding module; Homology modeling;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Homology modeling study toward identifying structural properties in the HA2 B-loop that would influence the HA1 receptor-binding site

Keywords: مدل سازی همگرا; B-loop; Hemagglutinin; Homology modeling; Influenza A H1N1 subtype; Receptor-binding site;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Role of N-acetylserotonin O-methyltransferase in bipolar disorders and its dynamics

Keywords: مدل سازی همگرا; Molecular dynamics; Glycoproteins; Bipolar disorder; N-Acetylserotonin O-methyltransferase; Homology modeling; Water box;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Molecular dynamics investigation of Cl− transport through the closed and open states of the 2α12β2γ2 GABAA receptor

Keywords: مدل سازی همگرا; Gamma-aminobutyric type A receptor (GABAAR); Homology modeling; Molecular dynamics (MD) simulation; Adaptive biasing force (ABF);

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Sequence analysis and structure prediction of enoyl-CoA hydratase from Avicennia marina: Implication of various amino acid residues on substrate-enzyme interactions

Keywords: مدل سازی همگرا; ECH; enoyl-CoA hydratase; AMECH; Avicennia marina enoyl-CoA hydratase; DAC-CoA; dimethyl amino cinnamoyl-CoA; SPDV; swiss PDB viewer; Homology modeling; Structure prediction; Substrate interactions; Salt stress;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

A heterotetrameric alpha-amylase inhibitor from emmer (Triticum dicoccon Schrank) seeds

Keywords: مدل سازی همگرا; Triticum dicoccon; Heterotetrameric α-amylase inhibitor; CM protein; Tandem mass spectrometry; Kinetic study; Homology modeling;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

What can naturally occurring mutations tell us about Cav1.x channel function?

Keywords: مدل سازی همگرا; L-type calcium channel; Channelopathy; Structure-function analysis; Homology modeling;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

A novel homology model of TRPC3 reveals allosteric coupling between gate and selectivity filter

Keywords: مدل سازی همگرا; BAPTA; 1,2-bis(o-aminophenoxy)ethane-N,N,N′,N′-tetraacetic acid; GPCR; G protein coupled receptor; PLC; phospholipase C; DAG; diacylglycerol; SAG; 1-stearoyl-2-arachidonoyl-sn-glycerol; TRPC3; Homology modeling; Selectivity; Gating;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Mdm10 is an ancient eukaryotic porin co-occurring with the ERMES complex

Keywords: مدل سازی همگرا; Eukaryotic β-barrel protein; Multiple sequence alignment; Homology modeling; Phylogenetic analysis; ERMES; SAM;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه

Structural bioinformatics of the general transcription factor TFIID

Keywords: مدل سازی همگرا; Homology modeling; Transcription factor; TFIID; TAF;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2013 سفارش ترجمه