کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
10157807 | 1666485 | 2018 | 53 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Transcriptional profiling of the CAM plant Agave salmiana reveals conservation of a genetic program for regeneration
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
FAENormalized frequencyCIMBAPPIN2DGEVariable pressure scanning electron microscopyCYCD3DAPIAP2PLTCPCE2FShort Read ArchiveESR2RPKMTMMCyclin DAgave salmianacounts per millionRBRFunctional categoryORFBBMNCBILBDFDRCPMNGS6-Benzylaminopurine - 6-بنزیلامینوپورینEsr1 - ESR1PCA - PCAApetala 2 - آپتال 2opening reading frame - باز کردن قاب خواندنRegeneration - باززاییreads per kilobase per million - به ازای هر کیلو بایت در هر میلیونDifferential gene expression - بیان ژن دیفرانسیلMAI - بیشترPrincipal component analysis - تحلیل مولفههای اصلی یا PCANext-generation sequencing - تعیین توالی نسل بعدیLTP - تقویت طولانی مدت یا LTP Sra - خانمHierarchical clustering - خوشه بندی سلسله مراتبیBaby boom - رونق کودکRIN - رینCAM - ساخت به کمک کامپیوترDEG - شماRNA Integrity Number - شماره یکپارچه RNAElongation factor 2 - ضریب اصطکاک 2Coding Potential Calculator - ماشین حساب پتانسیل کدگذاریCrassulacean Acid Metabolism - متابولیسم اسید CrassulaceanSEM - مدل معادلات ساختاری / میکروسکوپ الکترونی روبشیNational Center of Biotechnology Information - مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژیfalse discovery rate - میزان کشف کاذبScanning electron microscopy - میکروسکوپ الکترونی روبشیGene ontology - هستیشناسی ژنیPET - پتlipid transfer protein - پروتئین انتقال لیپیدPEG - پلیاتیلن گلیکول Pin1 - پین 1PIN-FORMED - پین فرمDifferentially expressed gene - ژن بیان شده متفاوت استCO2 - کربن دیاکسیدScarecrow - کلوچهCallus - کولوسSCR - یکسوساز کنترلشده با سیلیکون
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
بیولوژی سلول
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
In plants, the best characterized plant regeneration process is de novo organogenesis. This type of regeneration is characterized by the formation of a multicellular structure called callus. Calli are induced via phytohormone treatment of plant sections. The callus formation in plants like Agave species with Crassulacean Acid Metabolism (CAM) is poorly studied. In this study, we induced callus formation from Agave salmiana leaves and describe cell arrangement in this tissue. Moreover, we determined and analyzed the transcriptional program of calli, as well as those of differentiated root and leaf tissues, by using RNA-seq. We were able to reconstruct 170,844 transcripts of which 40,644 have a full Open Reading Frame (ORF). The global profile obtained by Next Generation Sequencing (NGS) reveals that several callus-enriched protein coding transcripts are orthologs of previously reported factors highly expressed in Arabidopsis calli. At least 62 genes were differentially expressed in Agave calli, 50 of which were up-regulated. Several of these are actively involved in the perception of, and response to, auxin and cytokinin. Not only are these the first results for the A. salmiana callus, but they provide novel data from roots and leaves of this Agave species, one of the largest non-tree plants in nature.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Developmental Biology - Volume 442, Issue 1, 1 October 2018, Pages 28-39
Journal: Developmental Biology - Volume 442, Issue 1, 1 October 2018, Pages 28-39
نویسندگان
Sergio Alan Cervantes-Pérez, Annie Espinal-Centeno, Araceli Oropeza-Aburto, Juan Caballero-Pérez, Francisco Falcon, Alejandro Aragón-Raygoza, Lino Sánchez-Segura, Luis Herrera-Estrella, Andrés Cruz-Hernández, Alfredo Cruz-RamÃrez,