Genetic Loci on Chromosomes 4q25, 7p31, and 12p12 Are Associated With Onset of Lone Atrial Fibrillation Before the Age of 40 Years

BackgroundThree distinct genetic loci on chromosomes 1q21, 4q25, and 16q22 have been associated with atrial fibrillation (AF) in genome-wide association studies (GWAS). Five additional loci have been associated primarily with the PR interval and subsequently with AF. We aimed to investigate if 8 single nucleotide polymorphisms (SNPs), representing the 8 genomic loci previously linked with AF in genome-wide association studies, were associated with early-onset lone AF.MethodsWe included 209 patients with early-onset lone AF, and a control group consisting of 534 individuals free of AF. The 8 SNPs were genotyped using TaqMan assays (Applied Biosystems, Foster City, CA).ResultsThree SNPs were found to be significantly associated with early-onset lone AF: rs2200733 closest to PITX2 (odds ratio [OR], 1.62; 95% confidence interval [CI], 1.16-2.27; P = 0.004), rs3807989 near to CAV1 (OR 1.35; 95% CI, 1.06-1.72; P = 0.015), and rs11047543 near to SOX5 (OR 1.70; 95% CI, 1.18-2.44; P = 0.004). When correcting for multiple testing, rs2200733 and rs11047543 were still significantly associated with AF.ConclusionsThree SNPs, rs2200733 (4q25), rs3807989 (7p31), and rs11047543 (12p12), were associated with early-onset lone AF. All 3 SNPs are positioned close to genes that in previous studies have been demonstrated to be important for cardiac morphology/development, thereby suggesting a link between these SNPs and structural heart disease. Our results however, indicate that variants in these 3 loci are associated with AF through mechanisms that do not involve major structural abnormalities in the heart.

RésuméIntroductionTrois loci génétiques distincts sur les chromosomes 1q21, 4q25 et 16q22 ont été associés à la fibrillation auriculaire (FA) dans les études d'associations pangénomiques (ÉAP, ou GWAS : genome-wide association studies). Cinq loci additionnels ont été associés dans un premier temps à l'intervalle PR et subséquemment à la FA. Notre but était d'évaluer si les 8 polymorphismes de nucléotide simple (SNP : single nucleotide polymorphism), représentant les 8 loci génétiques qui avaient été liés à la FA dans les études d'associations pangénomiques, étaient associés à la FA précoce seule.MéthodesNous avons inclus 209 patients ayant une FA précoce seule et un groupe témoin de 534 individus n'ayant pas de FA. Le génotypage des 8 SNP a été fait en utilisant les essais TaqMan (Applied Biosystems, Foster City, CA).RésultatsTrois SNP se sont avérés être significativement associés à la FA précoce seule : rs2200733 plus près du PITX2 (ratio d'incidence approché [RIA], 1,62; intervalle de confiance [IC] de 95 %, 1,16-2,27; P = 0,004), rs3807989 près du CAV1 (RIA 1,35; IC de 95 %, 1,06-1,72; P = 0,015) et rs11047543 près du SOX5 (RIA 1,70; IC de 95 %, 1,18-2,44; P = 0,004). Lorsque corrigés pour les tests multiples, rs2200733 et rs11047543 ont encore été significativement associés à la FA.ConclusionsTrois SNP, rs2200733 (4q25), rs3807989 (7p31) et rs11047543 (12p12) ont été associés à la FA précoce seule. Les 3 SNP sont positionnés près des gènes qui, dans les études précédentes, se sont avérés importants dans la morphologie et le développement du cœur, suggérant ainsi un lien entre ces SNP et la maladie cardiaque structurelle. Cependant, nos résultats indiquent que les variants de ces 3 locis sont associés à la FA par des mécanismes qui n'impliquent pas les anomalies structurelles majeures du cœur.