کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
5907715 1160861 2015 5 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Discovering enhancers by mapping chromatin features in primary tissue
ترجمه فارسی عنوان
کشف تقویت کننده ها با نقشه برداری از ویژگی های کروماتین در بافت اولیه
ترجمه چکیده
تقویت کننده ها با مامورین کار می کنند تا زمان بندی، موقعیت مکانی و سطح بیان ژن را اصلاح کنند. همانطور که آنها این توابع را انجام می دهند، تقویت کننده های فعال یک محیط کروماتین ایجاد می کنند که از مناطق دیگر ژنوم متمایز است. بنابراین، ویژگی های کروماتین مرتبط با تقویت پروفایل می تواند نقشه های گسترده ژنوم عناصر کنترل کننده بالقوه را تولید کند. این بررسی بر روی تکنولوژی های فعلی که برای تولید نقشه های بالقوه های بالقوه بافت با استفاده از پروفیل کروماتین از بافت اولیه تمرکز دارد. اول، سلول ها از کلیه ارگانیزم ها جدا می شوند، به وسیله تمیزکاری، سلول های خودکار سلولی یا میکرو دیسکسیون. جداسازی بافت قبل از تجزیه و تحلیل، تضمین می کند که امضای مولکول تقویت کننده های فعال در یک سیگنال میانگین از انواع سلولی نامربوط گم نخواهد شد. پس از جداسازی سلول، ویژگی مولکولی که بر روی پروفیل قرار دارد، بستگی به فراوانی و کیفیت مواد برداشت شده دارد. ترکیبی از جداسازی بافت به علاوه پروفیل کروماتین در سراسر ژنوم، موفقیتآمیزان را در چندین مطالعات پیشگام شناسایی کرده است. در آینده، دستگاه نظارتی بافت سالم و بیمار به این شیوه مورد بررسی قرار خواهد گرفت، به عنوان محققان از تکنیک های ترکیبی برای به دست آوردن بینش در مورد اینکه چگونه فعال کننده ها ممکن است بر پیشرفت بیماری تاثیر بگذارد، استفاده می کنند.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی ژنتیک
چکیده انگلیسی
Enhancers work with promoters to refine the timing, location, and level of gene expression. As they perform these functions, active enhancers generate a chromatin environment that is distinct from other areas of the genome. Therefore, profiling enhancer-associated chromatin features can produce genome-wide maps of potential regulatory elements. This review focuses on current technologies used to produce maps of potential tissue-specific enhancers by profiling chromatin from primary tissue. First, cells are separated from whole organisms either by affinity purification, automated cell sorting, or microdissection. Isolating the tissue prior to analysis ensures that the molecular signature of active enhancers will not become lost in an averaged signal from unrelated cell types. After cell isolation, the molecular feature that is profiled will depend on the abundance and quality of the harvested material. The combination of tissue isolation plus genome-wide chromatin profiling has successfully identified enhancers in several pioneering studies. In the future, the regulatory apparatus of healthy and diseased tissues will be explored in this manner, as researchers use the combined techniques to gain insight into how active enhancers may influence disease progression.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Genomics - Volume 106, Issue 3, September 2015, Pages 140-144
نویسندگان
,