کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
6494521 | 44811 | 2014 | 16 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Comparative genomics revealed key molecular targets to rapidly convert a reference rifamycin-producing bacterial strain into an overproducer by genetic engineering
ترجمه فارسی عنوان
ژنومیک مقایسه ای، اهداف کلیدی مولکولی را برای تبدیل سریع یک رشته کنترل کننده ریفامایسین باکتریایی به یک تولید کننده بیش از پیش توسط مهندسی ژنتیک
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
ABCPTSLAPPKSMFSPEPDEGsSNVsNTGRMAMethylmalonyl-CoA mutaseAmycolatopsis mediterraneippGppOmyDCWAHBASDSN-methyl-N′-nitro-N-nitrosoguanidine - N-methyl-N'-nitro-N-nitrosoguanidineUltraviolet - اشعه فرابنفشMajor facilitator superfamily - بزرگترین تسهیل کننده خانوادگیStrain improvement - بهبود فشارPerfect Match - بهترین همسانcoding sequences - توالی کدگذاریRifamycin - ریفامپینGYM - سالن ورزشsodium dodecyl sulfate - سدیم دودسیل سولفاتPolyketide synthase - سنتاز پلیکرتینinorganic phosphate - فسفات معدنیphosphoenolpyruvate - فسفوآنولپیرواتRobust multi-array average - متوسط چند آرایه قویdry cell weight - وزن سلول خشکPolyphosphate - پلی فسفاتPolyp - پولیپDifferentially expressed genes - ژن های متفاوت بیان شده استCdS - کادمیم سولفید، سولفید کادمیمATP-binding cassette - کیت اتصال به ATP
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
مهندسی شیمی
بیو مهندسی (مهندسی زیستی)
چکیده انگلیسی
Rifamycins are mainstay agents in treatment of many widespread diseases, but how an improved rifamycin producer can be created is still incompletely understood. Here, we describe a comparative genomic approach to investigate the mutational patterns introduced by the classical mutate-and-screen method in the genome of an improved rifamycin producer. Comparing the genome of the rifamycin B overproducer Amycolatopsis mediterranei HP-130 with those of the reference strains A. mediterranei S699 and U32, we identified 250 variations, affecting 227 coding sequences (CDS), 109 of which were HP-130-specific since they were absent in both S699 and U32. Mutational and transcriptional patterns indicated a series of genomic manipulations that not only proved the causative effect of mutB2 (coding for methylmalonyl-CoA mutase large subunit) and argS2 (coding for arginyl tRNA synthetase) mutations on the overproduction of rifamycin, but also constituted a rational strategy to genetically engineer a reference strain into an overproducer.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Metabolic Engineering - Volume 26, November 2014, Pages 1-16
Journal: Metabolic Engineering - Volume 26, November 2014, Pages 1-16
نویسندگان
Clelia Peano, Fabrizio Damiano, Mattia Forcato, Alessandro Pietrelli, Carla Palumbo, Giorgio Corti, Luisa Siculella, Fabio Fuligni, Guidantonio Malagoli Tagliazucchi, Giuseppe Egidio De Benedetto, Silvio Bicciato, Gianluca De Bellis, Pietro Alifano,