کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
6494550 | 44813 | 2014 | 12 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
A novel platform for automated high-throughput fluxome profiling of metabolic variants
ترجمه فارسی عنوان
یک پلت فرم ریاضی برای تجزیه و تحلیل اتوماتیک جریان شبیه سازی انواع متابولیک
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
TSP-d4G6PDHPYROD600HCAFluxomicsTCAPPPHEPARSDCDWnuclear magnetic resonance - رزونانس مغناطیسی هستهایPCA - PCAAutomation - اتوماسیونrelative standard deviation - انحراف استاندارد نسبیdissolved oxygen - اکسیژن محلولHigh-throughput - با توان بالاhierarchical clustering analysis - تجزیه و تحلیل خوشه ای سلسله مراتبیStatistical analysis - تحلیل آماریPrincipal component analysis - تحلیل مولفههای اصلی یا PCAoptical density at 600 nm - تراکم نوری در 600 نانومترNMR - تشدید مغناطیسی هستهای High throughput - توان بالاLiquid handling - دستکاری مایعMass spectrometry - طیف سنجی جرمیFlux calculation - محاسبه شارpentose phosphate pathway - مسیر پنتوز فسفاتwild type - نوع وحشیcell dry weight - وزن خشک سلولیtricarboxylic acid cycle - چرخه اسید تریکاربوکیلیکglucose-6-phosphate dehydrogenase - گلوکز 6-فسفات دهیدروژناز
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
مهندسی شیمی
بیو مهندسی (مهندسی زیستی)
چکیده انگلیسی
Advances in metabolic engineering are enabling the creation of a large number of cell factories. However, high-throughput platforms do not yet exist for rapidly analyzing the metabolic network of the engineered cells. To fill the gap, we developed an integrated solution for fluxome profiling of large sets of biological systems and conditions. This platform combines a robotic system for 13C-labelling experiments and sampling of labelled material with NMR-based isotopic fingerprinting and automated data interpretation. As a proof-of-concept, this workflow was applied to discriminate between Escherichia coli mutants with gradual expression of the glucose-6-phosphate dehydrogenase. Metabolic variants were clearly discriminated while pathways that support metabolic flexibility towards modulation of a single enzyme were elucidating. By directly connecting the data flow between cell cultivation and flux quantification, considerable advances in throughput, robustness, release of resources and screening capacity were achieved. This will undoubtedly facilitate the development of efficient cell factories.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Metabolic Engineering - Volume 25, September 2014, Pages 8-19
Journal: Metabolic Engineering - Volume 25, September 2014, Pages 8-19
نویسندگان
Stéphanie Heux, Juliette Poinot, Stéphane Massou, Serguei Sokol, Jean-Charles Portais,