کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
8646182 | 1570072 | 2018 | 26 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Meta-genomics study among four contact lens wearers from India
ترجمه فارسی عنوان
متا ژنومیکس در میان چهار نفر از لنزهای تماسی از هند مطالعه می کند
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
CefotaximeTBEIMPEtBrMBLdNTPtrpERNDACSAKPCCLSIDTTPPASPSHVN-acetyl muramic acidAmpCNDMdATPdCTPdGTPPPSAAPHPBPVIMKlebsiella pneumoniae carbapenemaseExoμgMicrogramESBLMLSTMgCl2CACRPMImipenemaseKClCECThermus aquaticusANTAACCRISPRμLFOSASMRGESATCCDNA - DNA یا اسید دزوکسی ریبونوکلئیکAminoglycoside acetyltransferase - آمینوگلیکوزید استیل ترانسفرازethidium bromide - اتیدیوم برومایدEDTA - اتیلن دی آمین تترا استیک اسید Ethylene diamine tetra acetic acid - اتیلن دیامین تترا استیک اسیدDIM - اذعانMRSA - استافیلوکوک اورئوس مقاوم به متی سیلین یا MRSA Methicillin resistant Staphylococcus aureus - استافیلوکوک اورئوس مقاوم به متیسیلینUltra-violet radiation - اشعه ماوراء بنفشExotoxin - اگزوتوکسینTem - این استextended spectrum beta-lactamases - بتا لاکتاماهای طیف گسترده ایclustered regularly interspaced short palindromic repeats - به طور منظم تکرار پینگندرومی کوتاه مدت میان دو طرف تقسیم می شودTaq - تاکNext generation sequencing - توالی نسل بعدیdirect repeats - تکرار مستقیمseconds - ثانیهMutL - خوشحالdeoxycytidine triphosphate - دئوسسیتییدین تری فسفاتdeoxynucleoside triphosphate - دئوکسینوکلئوزید تری فسفاتdeoxyadenosine triphosphate - دایکا سوزیدنوسین تری فسفاتminutes - دقایقdeoxyguanosine triphosphate - دگزسی گوانوزین تری فسفاتCelsius - سانتیگرادCeftazidime - سفتازیدیمShikimate dehydrogenase - شیکیته دهیدروژنازbrain heart infusion broth - ضربان قلب مغزNormal flora - فلور طبیعیAmerican Type Culture Collection - مجموعه فرهنگی نوع آمریکاییStreptomycin resistance - مقاومت استرپتومایسینClinical and Laboratory Standards Institute - موسسه استاندارد های بالینی و آزمایشگاهیmillimolar - میلی آمپرmilliliter - میلی لیترMicrobiome - میکروبیومMicroliter - میکرولیترNAM - نامpolymerase chain reaction - واکنش زنجیره ای پلیمرازPCR - واکنش زنجیرهٔ پلیمرازVEB - وب سایتvolts - ولتpenicillin binding proteins - پروتئین های مرتبط با پنی سیلینrotation per minute - چرخش در دقیقهMagnesium chloride - کلرید منیزیمPotassium chloride - کلرید پتاسیم
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
چکیده انگلیسی
Human conjunctival flora plays an important role in protecting the eye. Contact lens wearers are prone to have changes in conjunctiva flora. This study aims at assessing the variability of conjunctiva flora among contact lens wearers. We performed Ion Torrent based 16s metagenomic sequencing from 4 contact lens wearers conjunctiva swab samples. Proteobacteria found to be the most predominant phylum present in all samples. On genus level we have detected 250 bacterial strains and we found upto 455 species bacterial strains at class level, the sample was found to be most enriched with Alpha proteobacteria (52%), Gamma proteobacteria (18%) and Actinobacteria (9%) and Bacilli (6%). Order level, analysis showed presence of 52% of Alpha proteobacteria with Rhodobacterales (29%), Sphingomanadales (20%), and 1% Caulobacterales order followed by 18% of Gamma proteobacteria with Pseudomonadales (15%), Xanthomanadales (1%), 13% of Beta proteobacteria occupies Burkholderiales and 5% of Bacillales. Wearing contact lens may increase the risk of eye infections and also from the data we found that opportunistic infections may not only be caused by predominant species like cultivable Pseudomanas but also be due to uncultivable bacteria found in conjunctival swab samples the detection of which was made possible by next generation sequencing.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Gene Reports - Volume 12, September 2018, Pages 208-217
Journal: Gene Reports - Volume 12, September 2018, Pages 208-217
نویسندگان
Murugan Nandagopal, Durgadevi Parthasarathy, Rajeswari Mahadevan, Padmapriya Jayavel, Hajib N Madhavan, Malathi Jambulingam,