کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
10826050 | 1064698 | 2013 | 10 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Advances in integrative modeling of biomolecular complexes
ترجمه فارسی عنوان
پیشرفت در مدل سازی تلفیقی مجتمع های بیولوژیکی
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
AFMComputational structural biologyCCSNOEThree-dimensionalRMSDnuclear magnetic resonance - رزونانس مغناطیسی هستهایnuclear overhauser effect - اثر بیش از حد هسته ایparamagnetic relaxation enhancement - افزایش آرام سازی پارامغناطیسFörster resonance energy transfer - انتقال انرژی تابشی ForsterFRET - انتقال انرژی رزونانسی فورسترSimulated annealing - بازپخت شبیه سازی شدهion mobility - تحرک یونNMR - تشدید مغناطیسی هستهای Electron paramagnetic resonance - تشدید پارامغناطیس الکترونEPR - تشدید پارامغناطیس الکترونPseudocontact shifts - تغییرات متناوبHaddock - حدیثMolecular dynamics - دینامیک ملکولی یا پویایی مولکولیPCs - رایانه های شخصیHybrid methods - روش های ترکیبیStem - ساقهMass spectrometry - طیف سنجی جرمیpre - قبل ازRestraints - محدودیت هاCollision cross section - مقطع برخوردroot mean square deviation - میانگین انحراف مربع ریشهElectron microscopy - میکروسکوپ الکترونیscanning transmission electron microscopy - میکروسکوپ الکترونی انتقال اسکنatomic force microscopy - میکروسکوپ نیروی اتمی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شیمی
چکیده انگلیسی
High-resolution structural information is needed in order to unveil the underlying mechanistic of biomolecular function. Due to the technical limitations or the nature of the underlying complexes, acquiring atomic resolution information is difficult for many challenging systems, while, often, low-resolution biochemical or biophysical data can still be obtained. To make best use of all the available information and shed light on these challenging systems, integrative computational tools are required that can judiciously combine and accurately translate sparse experimental data into structural information. In this review we discuss the current state of integrative approaches, the challenges they are confronting and the advances made regarding those challenges. Recent developments are underpinned by noteworthy application examples taken from the literature. Within this context, we also position our data-driven docking approach, HADDOCK that can integrate a variety of information sources to drive the modeling of biomolecular complexes. Only a synergistic combination of experiment and modeling will allow us to tackle the challenges of adding the structural dimension to interactomes, shed “atomic” light onto molecular processes and understand the underlying mechanistic of biomolecular function. The current state of integrative approaches indicates that they are poised to take those challenges.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Methods - Volume 59, Issue 3, 1 March 2013, Pages 372-381
Journal: Methods - Volume 59, Issue 3, 1 March 2013, Pages 372-381
نویسندگان
Ezgi Karaca, Alexandre M.J.J. Bonvin,