A non-polyenic antifungal produced by a Streptomyces yatensis strain isolated from Mellah Lake in El Kala, North-East of Algeria

SummaryObjectiveThis study aimed at describing one actinomycete strain E65 that was isolated from the water of Mellah Lake in El Kala, North-East of Algeria that produces a non-polyenic antifungal.Materials and methodsActinomycetes were isolated from Mellah Lake water and screened for antimicrobial activity. Antimicrobial assays were performed on ISP2 agar. The taxonomic position of the strain E65 was determined regarding phenotypic and 16S DNA sequences features. Time course of antifungal metabolites production was evaluated against Candida albicans on ISP2, ISP1 and GYEA broth. The active antifungal compound was extracted using dichloromethane and revealed by a thin layer of chromatography, chemical reagents, UV-visible and infrared spectroscopy.ResultsA total of 104 actinomycetes were isolated and screened for antimicrobial activity; 21 strains were active against Staphylococcus aureus, Escherichia coli and Candida albicans. The strain E65 showed a high in vitro activity against S. aureus and C. albicans and a good antifungal activity against a clinical C. albicans strain resistant to 5-fluorocytosine. Its 16S rRNA sequence shared 99% similarity with the Streptomyces yatensis type strain within the Streptomyces violaceusniger subclade of the Streptomyces hygroscopicus clade. It produced a non-polyenic antifungal, the IR spectrum of the antifungal extract corresponded to none of the antimicrobials compounds known to be produced by actinomycete of the S. hygroscopicus clade.ConclusionThe wetlands of El Kala, Algeria are a potential source of bioactive actinomycete that deserves to be explored and exploited. The Streptomyces yatensis E65 strain isolated from Mellah Lake brackish water produces a remarkable antifungal compound which original non-polyenic structure warrants further characterization.

RésuméObjectifL’étude de l’activité antimicrobienne des souches d’actinomycètes isolées du lac El Mellah, parc national d’El Kala, d’établir la position taxonomique de la souche E65 et d’analyser son extrait antifongique.Matériels et méthodesLe screening de l’activité antimicrobienne est réalisé sur gélose ISP2, la position taxonomique de la souche E65 est établie à partir des caractères phénotypiques et l’étude moléculaire, la cinétique de croissance et de production des molécules antifongiques sur Candida albicans sont étudiés sur bouillon ISP1, ISP2 et GYEA, la molécule antifongique est extraite avec du dichlorométhane et révélée sur chromatographie en couche mince, avec des révélateurs chimiques et une spectroscopie UV-visible et infrarouge.RésultatsUn total de 104 souches d’actinomycètes ont été isolées et examinées pour leurs activités antimicrobiennes, 21 souches étaient actives contre Staphylococcus aureus, Escherichia coli et Candida albicans. La souche E65 a montré une forte activité in vitro contre Staphylococcus aureus et Candida albicans et une bonne activité contre une souche C. albicans résistante à la 5-fluorocytosine. Cette souche est identifiée comme Streptomyces yatensis appartenant au sous-groupe des « Streptomyces violaceusniger » du groupe « Streptomyces hygroscopicus ». La souche E65 produit un antifongique non polyénique, son spectre infrarouge ne correspond à aucun des composés antimicrobiens connus pour être produit par les souches du groupes « S. hygroscopicus ».ConclusionLa souche E65 isolée des eaux du lac Mellah d’El Kala en Algérie a donné une molécule antifongique intéressante de nature non polyénique et que la zone humide d’El Kala sont visiblement une source d’actinomycètes bioactifs qui méritent d’être explorées et exploitées.