Detection and identification of Candida sp. by PCR in candidemia diagnosis

SummaryThe polymerase chain reaction was used for targeting species-specific sequences rDNA of five medical important yeasts most common isolated from blood.ObjectivesEvaluate the potential value of the nested PCR in species detection and identification of Candida sp. from patients at risk.Patients and methodsOne hundred and fifty seven samples were drawn from 76 patients who were at risk for developing candidiasis hospitalized at Habib-Bourguiba Sfax hospital and from 20 healthy volunteers. Each sample was used simultaneously for conventional fungal blood culture and for detection and identification of Candida DNA by nested PCR.ResultsForty-nine patients were PCR positive. Nineteen of these patients were culture positive. One patient having candidemia due to Candida guillermondii has not been identified by our targeting nested PCR. The limit of detection of our targeting nested PCR was 1 fg from the five corresponding Candida sp.ConclusionsThe molecular method is significantly more sensitive and proved to be both simple and reproducible. It may offer potential advantages over conventional fungal blood cultures, especially in the therapeutic decision.

RésuméLa réaction de polymérisation en chaîne (PCR) a été utilisée pour cibler des séquences spécifiques des espèces dans l’ADN ribosomal des cinq espèces de levures les plus fréquemment isolées des hémocultures.ButÉvaluer la valeur de la nested PCR dans le diagnostic des candidémies.Matériels et méthodesCent cinquante-sept échantillons ont été obtenus à partir de 76 patients ayant des facteurs de risque de candidose invasive hospitalisé au CHU Habib-Bourguiba de Sfax et à partir de 20 volontaires en bonne santé. Pour chaque échantillon une culture et une nested PCR pour la détection et l’identification de Candida sp. ont été réalisées.RésultatsQuarante-neuf patients ont été positifs par nested PCR. Dix-neuf ont eu des cultures positives à levures. Un patient qui avait une candidémie due à Candida guillermondii n’a pas été identifié par nested PCR. La limite de détection de notre nested PCR a été de 1 fg pour les cinq espèces correspondantes de Candida.ConclusionLa méthode moléculaire est significativement plus sensible. Elle est simple et reproductible. Elle peut offrir ainsi un avantage potentiel, par rapport aux méthodes conventionnelles, dans les décisions thérapeutiques.