کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5589471 | 1404643 | 2016 | 36 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Targeted next generation sequencing of a panel of autism-related genes identifies an EHMT1 mutation in a Kleefstra syndrome patient with autism and normal intellectual performance
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
FSIQSNVOMIMACMGGATKhiPSCsADI-RNMDPTCANKRT-PCRVCFEHMT1Burrows-Wheeler alignerNSCDPP6NGSBWAMAFBDNF - BDNF یا فاکتور نورونزایی مشتقشده از مغز genomic DNA - DNA ژنومیExAC - ExacGenome Analysis Toolkit - ابزار تجزیه و تحلیل ژنومAutism spectrum disorder - اختلالات طیف اوتیسم گروهیAutism Diagnostic Observation Schedule - برنامه ریزی تشخیص اوتیسمintelligence quotient - بهره هوشیdevelopmental delay - تاخیر رشدStrand bias - تعصب رشته ایSET - تنظیمsingle nucleotide variation - تنوع نوکلئوتید تکNext generation sequencing - توالی نسل بعدیankyrin repeat - تکرار ankyrinreverse transcription PCR - رونویسی معکوس PCRHuman induced pluripotent stem cells - سلول های بنیادی تکامل یافته القا شده توسط انسانNeural stem cells - سلولهای بنیادی عصبیbrain derived neurotrophic factor - عامل مغز استخوان مغز استخوان استminor allele frequency - فراوانی آللی جزئیnonsense-mediated mRNA decay - فرسودن mRNA ناشی از بی معنی استvariant call format - فرمت تماس نوعیAutism Diagnostic Interview-Revised - مصاحبه تشخیصی اوتیسم- اصلاح شدهFull Scale Intelligence Quotient - مقیاس کامل اطلاعات امتیازintellectual disability - ناتوانی ذهنیASD - نقص سپتوم یا دیوارهی دهلیزیADOS - نوجوانانwild-type - نوع وحشیTargeted - هدفمندVariant - واژگانیpolymerase chain reaction - واکنش زنجیره ای پلیمرازPCR - واکنش زنجیرهٔ پلیمرازOnline Mendelian Inheritance in Man - وراث آنلاین مندلیان در انسانAmerican College of Medical Genetics and Genomics - کالج ژنتیک و ژنتیک پزشکی آمریکاpremature termination codon - کدون از بین بردن زودرسExome Aggregation Consortium - کنسرسیوم جمع آوری امتحان
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
Autism spectrum disorder (ASD) is a complex neurodevelopmental disorder with unknown genetic and environmental causation in most of the affected individuals. On the other hand, there are a growing number of ASD-associated syndromes, where the exact genetic origin can be revealed. Here we report a method, which included the targeted next generation sequencing (NGS) and filtering of 101 ASD associated genes, followed by database search. Next, RNA sequencing was used to study the region of interest at the transcriptional level. Using this workflow, we identified a de novo mutation in the euchromatic histone-lysine N-methyltransferase 1 gene (EHMT1) of an autistic patient with dysmorphisms. Sequencing of EHMT1 transcripts showed that the premature termination codon (Trp1138Ter) created by a single nucleotide change elicited nonsense-mediated mRNA decay, which led to haploinsufficiency already at the transcriptional level. Database and literature search provided evidence that this mutation caused Kleefstra syndrome (KS), which was confirmed by the presence of the disorder-specific phenotype in the patient. We provide a proof of principle that the implemented method is capable to elucidate the genetic etiology of individuals with syndromic autism. The novel mutation detected in the EHMT1 gene is responsible for KS's symptoms. In addition, further genetic factors might be involved in the ASD pathogenesis of the patient including a missense DPP6 mutation (Arg322Cys), which segregated with the autistic phenotype within the family.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Gene - Volume 595, Issue 2, 31 December 2016, Pages 131-141
Journal: Gene - Volume 595, Issue 2, 31 December 2016, Pages 131-141
نویسندگان
István Bock, Krisztina Németh, Klára Pentelényi, Péter Balicza, Anna Balázs, Mária Judit Molnár, Viktor Román, József Nagy, György Lévay, Julianna Kobolák, András Dinnyés,