کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5861283 | 1133757 | 2015 | 12 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Transcriptomics hit the target: Monitoring of ligand-activated and stress response pathways for chemical testing
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
FeNOCAANrf2ChIP-SeqZoledronateCdCl2APAPCPZPRHXBP1IfosfamidePHHPPARGAMIORPTEC/TERT1hypoxia inducible factor 1, alpha subunitTCXTROGAHREMDp53ATF4CIDprimary human hepatocyte - hepatocyte اولیه انسانHIF1a - HIF1ROS - ROSadefovir dipivoxil - آدفوویر دوپیفوکسیلAmiodarone - آمیودارونAcetaminophen - استامینوفن CSA - ایالات مؤتلفهٔ آمریکاTroglitazone - ترولیدازونROSI - رزیrosiglitazone - روزیگلیتازونZOL - زولCidofovir - سیدفوویرcisplatin - سیس پلاتینCyclosporine A - سیکلوسپورینAHazard identification - شناسایی خطرTranscription factor - عامل رونویسیactivating transcription factor 4 - فعال کردن عامل رونویسی 4Fenofibrate - فنوفیبراتIbuprofen - قرص ایبوپروفن Ibu - مادرMetformin - متفورمینTranscriptomics - متن ترانهMET - ملاقات کردPrimary rat hepatocyte - هپاتوسیت مویرگی اولیهhypo - هیپوValproic acid - والپروات و والپروات سدیم یا والپروئیک اسیدX-box binding protein 1 - پروتئین اتصال X جعبه 1Clodronate - کلدرونیتChloroacetaldehyde - کلرواساتالدئیدchlorpromazine - کلرپرمازینCadmium chloride - کلرید کادمیومReactive oxygen species - گونههای فعال اکسیژنaryl hydrocarbon receptor - گیرنده آرویل هیدروکربن
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
علوم محیط زیست
بهداشت، سم شناسی و جهش زایی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
High content omic methods provide a deep insight into cellular events occurring upon chemical exposure of a cell population or tissue. However, this improvement in analytic precision is not yet matched by a thorough understanding of molecular mechanisms that would allow an optimal interpretation of these biological changes. For transcriptomics (TCX), one type of molecular effects that can be assessed already is the modulation of the transcriptional activity of a transcription factor (TF). As more ChIP-seq datasets reporting genes specifically bound by a TF become publicly available for mining, the generation of target gene lists of TFs of toxicological relevance becomes possible, based on actual protein-DNA interaction and modulation of gene expression. In this study, we generated target gene signatures for Nrf2, ATF4, XBP1, p53, HIF1a, AhR and PPAR gamma and tracked TF modulation in a large collection of in vitro TCX datasets from renal and hepatic cell models exposed to clinical nephro- and hepato-toxins. The result is a global monitoring of TF modulation with great promise as a mechanistically based tool for chemical hazard identification.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Toxicology in Vitro - Volume 30, Issue 1, Part A, 25 December 2015, Pages 7-18
Journal: Toxicology in Vitro - Volume 30, Issue 1, Part A, 25 December 2015, Pages 7-18
نویسندگان
Alice Limonciel, Konrad Moenks, Sven Stanzel, Germaine L. Truisi, Céline Parmentier, Lydia Aschauer, Anja Wilmes, Lysiane Richert, Philip Hewitt, Stefan O. Mueller, Arno Lukas, Annette Kopp-Schneider, Martin O. Leonard, Paul Jennings,