کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
6372122 1319965 2013 10 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Parameter uncertainty in biochemical models described by ordinary differential equations
ترجمه فارسی عنوان
عدم قطعیت پارامتر در مدل های بیوشیمیایی که توسط معادلات دیفرانسیل معمولی توصیف می شود
کلمات کلیدی
ترجمه چکیده
درک مکانیک فیزیکی بهبود یافته از شبکه های بیوشیمی یکی از جاه طلبی های سیستم زیست شناسی است. مدل سازی محاسباتی امکان ادغام منابع مختلف داده های تجربی را فراهم می کند تا این فهم مفهومی را به آزمون به صورت کمی به کار بندد. هدف مدل سازی محاسباتی، دستیابی به مدل های پیش بینی و همچنین توضیحی برای پدیده های پیچیده است، در نتیجه تقریب های مفیدی از واقعیت با سطوح مختلف جزئیات. به عنوان پیچیدگی مورد نیاز برای توصیف سیستم های مختلف افزایش می یابد، بنابراین نیاز به تعیین اینکه چگونه چنین پیش بینی ها می تواند ساخته شود. علیرغم تلاش برای ایجاد ابزار تحلیل نااطمینانی موجود در حوزه، این روش ها هنوز در زمینه زیست شناسی سیستم ها به طور گسترده ای مورد استفاده قرار نگرفته است. علاوه بر این، مناسب بودن روش های مختلف به شدت به مسئله و سیستم تحت بررسی بستگی دارد. این بررسی مقدمه ای برای برخی از تکنیک های در دسترس و همچنین ارائه کلی از روش های پیشرفته برای تجزیه و تحلیل عدم قطعیت پارامتر فراهم می کند.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری علوم کشاورزی و بیولوژیک علوم کشاورزی و بیولوژیک (عمومی)
چکیده انگلیسی
Improved mechanistic understanding of biochemical networks is one of the driving ambitions of Systems Biology. Computational modeling allows the integration of various sources of experimental data in order to put this conceptual understanding to the test in a quantitative manner. The aim of computational modeling is to obtain both predictive as well as explanatory models for complex phenomena, hereby providing useful approximations of reality with varying levels of detail. As the complexity required to describe different system increases, so does the need for determining how well such predictions can be made. Despite efforts to make tools for uncertainty analysis available to the field, these methods have not yet found widespread use in the field of Systems Biology. Additionally, the suitability of the different methods strongly depends on the problem and system under investigation. This review provides an introduction to some of the techniques available as well as gives an overview of the state-of-the-art methods for parameter uncertainty analysis.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Mathematical Biosciences - Volume 246, Issue 2, December 2013, Pages 305-314
نویسندگان
, , , ,